要在Android Studio编译过程中去除应用的android.permission.QUERY_ALL_PACKAGES权限，您可以通过清单合并（Manifest Merger）来实现。清单合并可以帮助您解决应用清单文件中的冲突，并根据需要合并或去除权限。

您可以在应用的 build.gradle 文件中使用 tools:node="remove" 来指定去除权限。以下是一个示例：

<uses-permission android:name="android.permission.QUERY_ALL_PACKAGES" tools:node="remove" />

这将会在清单合并过程中去除应用清单文件中的 android.permission.QUERY_ALL_PACKAGES 权限。请确保将这行代码放置在应用的清单文件（一般是 AndroidManifest.xml）中的 <manifest> 标签内部。

这样做之后，清单合并工具会在编译时去除指定的权限，即使三方SDK引入了这个权限，也不会在最终的应用清单文件中包含它。