生信软件安装

1.sratools

下载及安装sra-tools软件(NCBI-download-download tools-SRA Toolkit  选择linux版本)

2.fastqc

3.trim

4.bowtie2

wget https://nchc.dl.sourceforge.net/project/bowtie-bio/bowtie2/2.3.4.2/bowtie2-2.3.4.2-linux-x86_64.zip

5.macs2

6.samtools

wget https://nchc.dl.sourceforge.net/project/samtools/samtools/1.9/samtools-1.9.tar.bz2 

7.igv

wget http://data.broadinstitute.org/igv/projects/downloads/2.4/IGV_2.4.14.zip

©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
平台声明:文章内容(如有图片或视频亦包括在内)由作者上传并发布,文章内容仅代表作者本人观点,简书系信息发布平台,仅提供信息存储服务。

推荐阅读更多精彩内容

  • 课程来源于生信技能树:http://www.biotrainee.com/forum.php?mod=viewth...
    JeremyL阅读 6,462评论 2 9
  • RNAseq实际操作(实战) 首先声明,虽然是实战,但是其实是学习笔记而已,初学,参考了大量大神的博客和帖子,还有...
    zd200572阅读 9,870评论 0 29
  • Introduction What is Bowtie 2? Bowtie 2 is an ultrafast a...
    wzz阅读 11,167评论 0 5
  • 今天参加了接口测试第一节课,给我的感觉是非常好,老师很负责人,短短三个月的课程安排很紧凑,课程内容很丰富,让我...
    刘巍l阅读 1,625评论 0 0
  • 短暂午休,看着家里一片狼藉,感叹毕业季的威力。 整点背景音乐,速速开始整理。 作业中的多戈把房门轻轻关了起来,我也...
    丁若木阅读 4,160评论 3 9