R中的reorder()函数用于将factor的level快速排序

用法：reorder(x, X, decreasing = FALSE)

• x为原始的vector
• X为期望因子排序的量，长度与x相同。若为character，按字母顺序排，若为数字，按从小到大的顺序排
• decreasing参数与order和sort的decreasing参数相同，默认为F，从小到大
• 注：若给第二个参数前添加负号，即-X，也可以达到按相反方向排序的效果

例：

> gene <- c("PSMD1", "GRPEL2", "UCK2", "SEPHS1","UTP11", "KPNA2", "EIF5B", "YARS1")
> coef <- c(0.0058, 0.0117, 0.0135, 0.0065,0.0515, 0.0007, 0.0008, 0.008)
> reorder(gene, coef)
[1] PSMD1  GRPEL2 UCK2   SEPHS1 UTP11  KPNA2  EIF5B  YARS1 
attr(,"scores")
 EIF5B GRPEL2  KPNA2  PSMD1 SEPHS1   UCK2  UTP11  YARS1 
0.0008 0.0117 0.0007 0.0058 0.0065 0.0135 0.0515 0.0080 
Levels: KPNA2 EIF5B PSMD1 SEPHS1 YARS1 GRPEL2 UCK2 UTP11

可以看到：

• reorder的返回值与原向量相同
• reorder的返回值的因子水平会按照第二个参数进行排序

• reorder在使用ggplot2进行画图时对横/纵坐标制定顺序时非常有用

例：

ggplot(mapping = aes(x = gene, y = coef)) + 
  geom_bar(stat = "identity")

reorder前

ggplot(mapping = aes(x = reorder(gene, coef), y = coef)) + 
  geom_bar(stat = "identity")

reorder后

参考

https://zhuanlan.zhihu.com/p/511112576