作业记录：用预编译方式在自己的Ubuntu系统虚拟上机安装生物信息软件SPAdes

和大部分软件安装过程相同，SPAdes软件的安装过程也分为下载和解压两部分，并为软件设置快捷打开的路径，此篇笔记的方法同样适用于大部分软件安装（不同软件包需要用不同解压指令进行解压）

①进入官网复制下载地址后用管理员权限wget命令下载适用Linix版本的软件并解压

wget https://cab.spbu.ru/files/release3.15.3/SPAdes-3.15.3-Linux.tar.gz  #软件下载

tar zvxf SPAdes-3.15.3-Linux.tar.gz  #软件解压，zvxf后为解压路径

下载完成

解压过程

②进入路径中查看软件信息，并在bashrc脚本中创建相对路径

cd SPAdes-3.15.3-Linux/bin  #进入目录bin

./spades.py -h  #查看SPAdes的使用信息

echo 'export PATH=/SPAdes-3.15.3-Linux/bin:$PATH' >> ~/.bashrc  #创建相对路径

source ~/.bashrc #应用脚本环境

SPAdes选项

出错

回到根目录检查相对路径是否创建成功时显示无法找到该命令，使用管理员权限进入bashrc文件检查输入的路径是否正确

sudo gedit ~/.bashrc  #进入bashrc编辑器

缺少根目录"~"路径

修改成正确路径后保存，再次应用环境进行检查

source ~/.bashrc  #应用脚本环境

spades.py -h  #查看SPAdes的使用信息

安装成功，可在根目录下便捷使用