生信星球第115期Day5笔记-Joe

Day5的学习任务:

今日重点:A、向量 B、数据框

·向量

1.标量与向量
凡是由一个元素组成的变量都为标量
凡是由大于一个元素组成的变量都为向量
“元素”是由数字或者字符串组成的,比如说,1、“breakfast”、“lunch”等等
使用这些元素、标量、向量时的一些”赋值“方式→

x<-c(1,2,3)#将x定义为由元素1,2,3组成的向量
x<-p1:10#选出1-10之间所有的整数
x<-seq(1,10,by=0.5)#1-10之间每隔0.5取一个数
x<-rep(1:3,times=2)#1-3 重复2次
--上摘自公众号”生信星球“

2.从向量中提取元素
a.根据元素的位置:
x[4]#x的第4个元素
x[-4]#排除法,除了第4个元素之外的剩余元素
x[2:4]#第2-4个元素
x[-(2:4)]#同理,除了第2-4个元素外的剩余元素
x[c(1,5)]#第1和第5个元素
b.根据值:
x[x==10]#等于10的元素
x[x<0]#小于0的元素
x[x%in%c(1,2,5)]#存在向量c(1,2,5)中的元素

·数据框

a.读取本地的数据(以生信星球的教程为例)
先确保要用的文件在你的工作目录里→

读取本地数据.png

read.table(file="huahua.txt",sep="\t",header=T)
a<-read.table(file="huahua.txt,sep="\t",header=T)

b.设置行名和列名
X<-read.csv('doudou.txt')#这里的变量X是一个数据框
colnames(X)#查看列名
rownames(X)#查看行名,默认值的行名就是行号1,2,3,4,5......
colnames(X)[1]<-"bioplanet"#该命令用于修改左上角空着的格子,本数据默认为X
X<-read.csv(file="huahua.txt",sep=" ",header=T,row.names=1)#row.names=1意为修改第一列为行名

行名和列名设置.png

c.数据框的导出
write.table(X,file="yi.txt",sep=",",quote=F)#分隔号改为逗号

数据框的导出.png

d.变量的保存以及重新加载
save.image(file="bioinfoplanet.RData")#保存当前所有变量
save(X,file="test.RData")#保存其中一个变量
load("test.RData")#再次使用RData时的加载命令

e.提取元素
X[x,y]#第x行第y列
X[x,]#第x行
X[,y]#第y列
X[y]也是第y列
X[a:b]#第a列到第b列
X[c(a:b)]#第a列和第b列
X$列名也可以提取列

--晕乎~~都是一群看不大懂的代码,还在仔细阅读帮助文档,希望能看出些东西TnT


help.png
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