GATK_Mutect关于样本名报错

image.png

这里需要输入两个样本名字,其实这两个$T and $N 的名字是限定死的,不可以乱取

image.png

例如这里虽然文件名使用了sample20170711-4_I6_S6_L007,但是其实实际上正确的$N 应该是sample20170711-4_I6_S6_L007_R1。否则会出现类似的报错

image.png

A USER ERROR has occurred: Bad input: Sample sample20170711-4_I6_S6_L007 is not in BAM header: [Msample20190927-1-I44_L4_D95T59, sample20170711-4_I6_S6_L007_R1]

image.png

这样才可以正常运行

最后编辑于
©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
平台声明:文章内容(如有图片或视频亦包括在内)由作者上传并发布,文章内容仅代表作者本人观点,简书系信息发布平台,仅提供信息存储服务。