数据结构

在这些数据类型里，生信学习者最需要熟悉的是向量和数据框。

part1：向量

1. 标量和向量的区分
   标量：一个元素组成的变量
   向量：多个元素组成的变量

   
   
   微信图片_20220506223514.png

2. 从向量中提取元素
   （1） 根据元素位置

这里的x是你刚才赋值的变量名，根据自己的情况来修改

x[4] #x第4个元素
x[-4]#排除法，除了第4个元素之外剩余的元素
x[2:4]#第2到4个元素
x[-(2:4)]#除了第2-4个元素
x[c(1,5)] #第1个和第5个元素```

（2） 根据值
x[x==10]#等于10的元素
x[x<0]
x[x %in% c(1,2,5)]#存在于向量c（1，2，5）中的元素```

Part2：数据框

（1）读取本地数据

微信图片_20220506225559.png

图片引用生信星球

（2）设置行名和列名
X<-read.csv('doudou.txt') #在示例数据里有doudou.txt 注意这里的变量X是一个数据框
colnames(X) #查看列名
rownames(X) #查看行名,默认值的行名就是行号，1.2.3.4...
colnames(X)[1]<-"bioplanet"#有的公司返回数据，左上角第一格为空，R会自动补为x,用这个命令来修改
X<-read.csv(file = "huahua.txt",sep = " ",header =T,row.names=1)#最后row.names的意思是修改第一列为行名

（3）数据框的导出
write.table(X,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F)#分隔符改为逗号，字符串不加双引号（默认格式带由双引号）

（4）变量的保存与重新加载
这次没有处理完的数据下次想接着用怎么办?--学会保存和重新加载。保存的格式是RData。
save.image(file="bioinfoplanet.RData")#保存当前所有变量
save(X,file="test.RData")#保存其中一个变量
load("test.RData")#再次使用RData时的加载命令

（5）提取元素

• X[x,y]#第x行第y列
• X[x,]#第x行
• X[,y]#第y列
• X[y] #也是第y列
• X[a:b]#第a列到第b列
• X[c(a,b)]#第a列和第b列
• X$列名#也可以提取列（优秀写法，而且这个命令还优秀到不用写括号的地步，并且支持Tab自动补全哦，不过只能提取一列）

上述代码和内容均引用自生信星球
学习思维导图

数据结构.png

save(X,file="test.RData")这句代码如果报错object X not found，是为什么，应该怎么解决？

答：X文件不存在或者找不到，解决方法把想保存的文件赋值给X或者直接用保存文件名字。