RNA高通量测序(RNA-seq)
定义
RNA-seq即转录组测序技术,就是把mRNA,smallRNA和NONcoding RNA等或者其中一些,用高通量测序技术进行测序分析,反映出它们的表达水平。其应用范围:
- 检测所有mRNA表达量的差异(最常见)。
- 检测RNA的结构上的差异,例如剪接方式的差。
- 基因单点突变导致的SNP
方法原理
测序方法
[测序流程]
原理
先去除保守的rRNA ,→polyA 尾的特性,用磁珠吸附→Mg镁离子溶液打断mRNA→随机引物变成双链合成第一条cDNA(由RNA变成单链DNA)→再合成第二条DNA(双链DNA)→用相应的酶切加上A,加上Y 行接头(adaptor)。
[原文链接]
(https://www.jianshu.com/p/923d0453a365)
数据分析
数据分析可以说是RNA-seq的重中之重!包括质量控制、读段比对、基因和转录本定量、差异性基因表达、功能分析、基因融合检测、eQTL图谱分析具体后面再学习啦,补点代码:
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// Created by youhui on 2018/11/21.
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功能:
用来解决vc生命周期已经执行,但是却被其他图层挡住,导致无法准确的拿到页面“可见化”的时机
通过传入target 在debut、each 两个block中可以分别拿到首次、每次的“可见化”回调