CRISPR-sgRNA设计

NCBI网站找到target gene 的CDS区域

  • 第一步:打开菜单栏,下拉到Gene,在搜索框输入目标基因GSTP1,然后进行Search


    1.png
  • 第二步:在Search后出现的页面里有很多种动物的基因,找到人的种属,单击进行查找


    2.png
  • 第三步:新出现的页面是目标基因GSTP1的介绍,下滑到核苷酸序列,点击GenBank模式查找其基因序列


    3.png
  • 第五步:最后保存我们查找到的序列,如图进行修改后,点击Create File Button就可以进行下一步分析了。


    4.png

网站设计sgRNA序列:

  • 网站有很多,这里只介绍zhanglab的一个网站:


    点击:CRISPOR

    输入序列-选择物种和crispr种类

sgRNA设计对比(spcas9为例)

spcas9-sgRNA设计示意图1

spcas9-sgRNA设计示意图2

cas9原理介绍

  • types of cas9


    image.png
  • spcas9 示意图


    Wikipedia
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