读《Single Cell Biomedicine》|| 新工具新视角

前两天朋友圈在传一本Xiangdong Wang老师的一本书:Single-cell Sequencing
and Methylation :Methods and Clinical Applications。于是在书库里面搜索的时候看到了这本书:Single Cell Biomedicine,也是Xiangdong Wang 老师参编的。这几年

单细胞技术是指面向单个细胞的分析技术合集,我们提过,它是一个应用层面。流式细胞是不是单细胞?是的,只是通量没有那么高。不能手里拿着锤子就看什么都是钉子,也不能一看到Single Cell 就想到scRNA,scVDJ,scATAC,应该想到在微环境中活生生的,细胞间相互交流,细胞内各种调控的细胞生态。

高通量的细胞技术(微流控+NGS)为我们在单细胞水平上看基因的调控、表达、翻译等信息,为我研究疾病机理提供了新的工具与视角。为什么单细胞技术是里程碑的呢?首先看里程碑在哪:个体,器官,组织,细胞,细胞器,生物分子。细胞处在这链条的中间位置:向上承接组织细胞类型,向下承接亚细胞单位。

而,单细胞作为生物器官和组织的基本单位,近年来被认为是进一步了解器官功能和生物学的分子机制的一个重要窗口。随着单细胞生物技术的发展,单细胞生物医学越来越成为了解细胞间异质性、识别疾病特异性生物标志物、探索分子调控和信号的重要领域。单细胞系统生物学是强调作为一种方法来理解单细临床表型,单细胞生物学,异质性。 多维度、多层、多交叉和立体的单细胞生物学必将有利于疾病特异性生物标志物的发现和开发、将单细胞系统生物学转化为临床表型、理解单细胞基因测序和患者对治疗反应的功能。作为单细胞生物医学的一部分,单细胞RNA测序(scRNAseq)被用作定义转录组的改变、瘤内和细胞间异质性的发展以及响应的基因毒性的关键和初始工具。

癌症的异质性可以通过单细胞测序和癌症细胞的全面分子特征来描述,包括遗传和体细胞的基因变化和突变。肿瘤细胞异质性的特异性、表征和作用决定了细胞对治疗的敏感性和耐药性,并被认为是基于提出的精确的自我验证系统开发靶向驱动疗法和临床试验策略的关键因素。

当然,单细胞不是终点。或者说,它展开了一个新的画卷。这是一项医学驱动的技术,所以他的学术,他的应用基本也都是面向临床的:机理与应用。以往的研究,特别是对异质性较强的癌症的研究,基于组织可能只能分型分期,到单细胞这可以看到每个癌细胞的状态。这里我们不禁要引用一句话:

If you can not see it , you can not stop it.

单细胞技术正好是一项 see it 的技术,我们可以中各个侧面看到单个细胞的性质,如基因的表达调控。虽然目前还都是没有离开中心法则,单细胞像是人口普查,为我们提供一个全景的概览,以便我们可以找到新的方向。

生物医学(Biomedicine)这个单词的核心是个体,根本是细胞。所以单细胞技术可以说是一个分界点,到亚细胞结构的研究偏向生物物理或者生物化学。单细胞技术的商业化,在2020年来看是学术界和产业界一同发展的。有不少科研院所的技术走出象牙塔挤进大教堂,这也是一个特点。

本书是编著,所以是围绕Single Cell Biomedicine这个主题几位专家展开的讨论。开卷是有益的,看大牛们的讨论,形成自己的思考。单细胞打开了一个维度,巧的是,单细胞本身也是一个维度。

感兴趣的章节我做了标注,不知道你有没用看到呢?

©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
  • 序言:七十年代末,一起剥皮案震惊了整个滨河市,随后出现的几起案子,更是在滨河造成了极大的恐慌,老刑警刘岩,带你破解...
    沈念sama阅读 194,088评论 5 459
  • 序言:滨河连续发生了三起死亡事件,死亡现场离奇诡异,居然都是意外死亡,警方通过查阅死者的电脑和手机,发现死者居然都...
    沈念sama阅读 81,715评论 2 371
  • 文/潘晓璐 我一进店门,熙熙楼的掌柜王于贵愁眉苦脸地迎上来,“玉大人,你说我怎么就摊上这事。” “怎么了?”我有些...
    开封第一讲书人阅读 141,361评论 0 319
  • 文/不坏的土叔 我叫张陵,是天一观的道长。 经常有香客问我,道长,这世上最难降的妖魔是什么? 我笑而不...
    开封第一讲书人阅读 52,099评论 1 263
  • 正文 为了忘掉前任,我火速办了婚礼,结果婚礼上,老公的妹妹穿的比我还像新娘。我一直安慰自己,他们只是感情好,可当我...
    茶点故事阅读 60,987评论 4 355
  • 文/花漫 我一把揭开白布。 她就那样静静地躺着,像睡着了一般。 火红的嫁衣衬着肌肤如雪。 梳的纹丝不乱的头发上,一...
    开封第一讲书人阅读 46,063评论 1 272
  • 那天,我揣着相机与录音,去河边找鬼。 笑死,一个胖子当着我的面吹牛,可吹牛的内容都是我干的。 我是一名探鬼主播,决...
    沈念sama阅读 36,486评论 3 381
  • 文/苍兰香墨 我猛地睁开眼,长吁一口气:“原来是场噩梦啊……” “哼!你这毒妇竟也来了?” 一声冷哼从身侧响起,我...
    开封第一讲书人阅读 35,175评论 0 253
  • 序言:老挝万荣一对情侣失踪,失踪者是张志新(化名)和其女友刘颖,没想到半个月后,有当地人在树林里发现了一具尸体,经...
    沈念sama阅读 39,440评论 1 290
  • 正文 独居荒郊野岭守林人离奇死亡,尸身上长有42处带血的脓包…… 初始之章·张勋 以下内容为张勋视角 年9月15日...
    茶点故事阅读 34,518评论 2 309
  • 正文 我和宋清朗相恋三年,在试婚纱的时候发现自己被绿了。 大学时的朋友给我发了我未婚夫和他白月光在一起吃饭的照片。...
    茶点故事阅读 36,305评论 1 326
  • 序言:一个原本活蹦乱跳的男人离奇死亡,死状恐怖,灵堂内的尸体忽然破棺而出,到底是诈尸还是另有隐情,我是刑警宁泽,带...
    沈念sama阅读 32,190评论 3 312
  • 正文 年R本政府宣布,位于F岛的核电站,受9级特大地震影响,放射性物质发生泄漏。R本人自食恶果不足惜,却给世界环境...
    茶点故事阅读 37,550评论 3 298
  • 文/蒙蒙 一、第九天 我趴在偏房一处隐蔽的房顶上张望。 院中可真热闹,春花似锦、人声如沸。这庄子的主人今日做“春日...
    开封第一讲书人阅读 28,880评论 0 17
  • 文/苍兰香墨 我抬头看了看天上的太阳。三九已至,却和暖如春,着一层夹袄步出监牢的瞬间,已是汗流浃背。 一阵脚步声响...
    开封第一讲书人阅读 30,152评论 1 250
  • 我被黑心中介骗来泰国打工, 没想到刚下飞机就差点儿被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留,地道东北人。 一个月前我还...
    沈念sama阅读 41,451评论 2 341
  • 正文 我出身青楼,却偏偏与公主长得像,于是被迫代替她去往敌国和亲。 传闻我的和亲对象是个残疾皇子,可洞房花烛夜当晚...
    茶点故事阅读 40,637评论 2 335