基因的可变剪切(alternative splicing)和蛋白异构体(Protein isoform)

写这个文章的原因是因为我在用Trinity组装转录组的时候，除去软件的原因，在生物体内有很多的可变剪切现象，定义就是一个mRNA前提可以通过不同的内含子出去方式获得成熟的mRNA。

图示

alternative_splicing.png

可变剪切的意义

可变剪切在真核生物中广泛纯在，可变剪切可以造成蛋白质组的多样性，另外在特定的组织中，也会造成不同的剪切异构体，可变剪切有不同的时间和空间变异。

概念区别

  • transcript variant: 强调一个基因产生了不同的mRNA
  • splice variant: 指从过程中来讲，强调内含子剪切方式不一刚
  • isoform: 指的是异构体的蛋白
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