终于把SyRI安装好了，看了一下上次安装syri无果以后，让师兄帮忙分析的syri结果的日期是2021/1/20，到现在为止，已历时10个月整，中间时不时地会试一下安装，但是还是放弃了。随着课题的进行，call SV还是要用各种方法来鉴定。硬着头皮再次捡起来。
没有退路，也就只能往前了。
今天终于解决了，激动之余，打算在简书写一下心酸历程，同时也感谢在此过程中提供帮助的各位老师!
网上有很多关于下载及安装SyRI的教程，可参考：https://github.com/schneebergerlab/syri （官网）
https://schneebergerlab.github.io/syri/install.html （安装指导）
https://schneebergerlab.github.io/syri/pipeline.html
首先是新建一个conda小环境，
conda create -n syri
然后安装syri1.4所需的python3.5（我是用conda直接安装的python3.5.5）
再按照要求安装所依赖的库或者包，
conda install cython numpy scipy pandas=0.23.4 biopython psutil matplotlib=3.0.0
conda install -c conda-forge python-igraph
conda install -c bioconda pysam
接下来，下载并安装syri
git clone https://github.com/schneebergerlab/syri.git
cd syri
python3 setup.py install # 安装syri
因为我们课题作用的服务器系统是Python2.7的环境，虽然在新建了conda环境专门安装syri所依赖的包/软件，因此在直接用python3 setup.py install 安装以后还是会调用系统的Python2.7，报错的问题无从下手，每次都会卡在这儿。
然后尝试指定python3的路径来安装
path/to/miniconda/envs/syri/bin/python3 setup.py install
安装成功，然后提交命令，用单条染色体尝试运行，没问题
其间还有系统的某个库需要更新，无奈之下，找服务器管理员老师帮忙更新
最后才成功。
有种拨开云雾见明月的感觉。
再次正式提交想分析的数据的时候，发现账号出现了更严重的问题，
qsub命令直接不能用了。老师又帮我开了一个新的账号
开心的是，我终于有属于自己的账号了，而不是蹭其他人的账号
然而不开心的是，刚安装好的syri就不能用了，从零开始开启一个新的账号。
还好，新账号还挺好用，之前安装失败的mummer一下子便安装好了，原来很多问题也不是因为自己笨，哈哈。。。
按照之前的经验重新安装syri，然而，又有新的问题出现
就算指定了python3的路径，还是调用系统的python2.7，再次报错。
无奈，尝试写到install.sh文件中，用qsub提交qsub -d ./ -e ./ -l walltime=120:00:00 installsyri.sh 竟然成功了，也不知道啥原因。
那么，开始分析数据吧。
又有新的报错：
usr/lib/libbz2.so.1.0: cannot open shared object file: No such file or directory
第一次见，那就百度吧
https://www.jianshu.com/p/848119d1e349?utm_campaign=maleskine&utm_content=note&utm_medium=seo_notes&utm_source=recommendation
再次感谢这位小姐姐还是小哥哥提供的思路，把系统中仅有的libbz2.so复制到 path/to/miniconda/envs/syri/lib 路径下，并软连接为libbz2.so.1.0
然后再次用qsub提交任务，刷新再刷新，关于报错的error文件始终为零，果然，没有消息就是最好的消息。终于克服~~~啦啦啦啦啦
我也是受助于人，一般都是通过百度，简书，微信群，以及之前跟着卖萌哥学习conda的知识加入的群，在群里，各位老师都提供过很多帮助，无论是关于conda还是关于服务器的其他方面问题，再次感谢! 以及课题组的各位老师 师兄 师姐 的答疑解惑。非常感激。
希望能够帮助到遇到类似问题的小伙伴们。
第一次写算不上教程的教程，有点啰嗦。。。（ 题外话：昨天晚上听说奶奶摔倒骨折了，一直在外地忙于所谓的学业，还未意识到奶奶上年龄了这个问题，今天早上一睁眼也是很担心的看了看手机，没有未接来电，才放心些，没有消息就是最好的消息。愿一切安好！）
两周一汇报的日子就要开始了
明天是第一次，然而进展寥寥无几~~
有导师的push也是幸福的吧，加油！！！
