2022-03-07：substr函数在TCGA数据中提取样本信息

1：了解substr函数（截取函数），从start位置开始提取字符串，示例如下

2：用substr函数在TCGA数据中提取样本信息

tumor <- colnames(expr)[as.integer(substr(colnames(expr),14,15)) < 10]

normal <- colnames(expr)[as.integer(substr(colnames(expr),14,15)) >= 10]

根据TCGA数据中14，15位代表样本性质来提取分组信息。通过substr函数，截取表达矩阵中（expr），列名的第14.15的数值（用as.integer 转变为整数），然后判断14,15位置上的数值，＜10（01-09）则为tumor组，＞10（11）是指normal组。


因此，通过上述代码，利用substr函数即可得到样本的分组信息。

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