自己也是入门生信很久了，但总是这学点，那学点，真要问会什么，却又都不精通。

今天开始，希望自己能够认真记录点点滴滴，争取早日掌握一门吃饭的技艺。

一个完整转录组学习正式开始

（感谢基因课）

重复文章——Transcriptome analysis of an apple (Malus × domestica)yellow fruit somatic mutation identifies a gene networkmodule highly associated with anthocyanin and epigeneticregulation

1. 查找文章上传数据登录号

Illumina sequencing of the pooled RNA-seq libraries yielded 24FASTQ files of sequences (PRJNA287523/SRP062637) with atotal of 327.5 million reads passed the Illumina Casava pipeline 1.8(Supplementary Table S3).

2.登录NCBI下载

登录NCBI→选择SRA→输入SRA登录号→Search→Send to→Run Selector→Go→prefetch SRR2176358→自动存到根目录下的ncbi/ 目录中 (prefetch 仅是演示下载一个数据，多个数据可以直接点Accession List，详情百度。官方下载数据方法，但不稳定，效果差 。)

3.sra-explorerg工具（最好可以fanqiang）

https://sra-explorer.info/
直接搜索登录号→Title→Add→点击购物车→选择Aspera(高速下载)→复制链接(仅演示一个数据下载)→粘贴Linux。（很明显的网速提升）

#如没有：Aspera 安装
1. wget https://download.asperasoft.com/download/sw/connect/3.9.1/ibm-aspera-connect-3.9.1.171801-linux-g2.12-64.tar.gz        
2. tar zxvf ibm-aspera-connect-3.9.1.171801-linux-g2.12-64.tar.gz        
3. sh ibm-aspera-connect-3.9.1.171801-linux-g2.12-64.sh         
4.  #添加环境变量                
    cd ~                
    vi .bashrc               
    echo  export PATH=~/.aspera/connect/bin:$PATH'                 
    source .bashrc        
5. ascp 回车 出现ascp教程即成功。

批量下载，我想大家应该也都会，下期开头我会简单介绍一下。