注:本文系本人翻译于github上interproscan的文档。
介绍
什么是InterProScan?
InterPro是一个数据库,它集成了来自许多合作伙伴关于蛋白质功能预测信息资源,提供了蛋白质所属的家族及其包含的域和位点的概述。
有新的核苷酸或蛋白序列的用户可以使用InterProScan软件包以集成的方式从InterPro数据库运行扫描算法对序列进行功能表征。序列需要以FASTA格式提交。然后根据所有必需的成员数据库签名进行计算匹配,并以各种格式输出结果。
支持平台
64-bit Linux 详情请见安装要求
目前还没有针对Windows或苹果(MAC OS X)操作系统的版本计划。
这是由于InterProScan运行的各种第三方二进制文件中的约束。
安装和运行InterProScan
有关使用InterProScan的更多信息,请参见下面的页面链接,例如,如何下载安装和如何运行InterProScan。