不管在用药还是在器械清洗、消毒、灭菌等环节，都离不开两个过程，即药动学和药效学。
针对灭菌来说，所谓药动学，研究灭菌介质的浓度或者量如何在腔内随时间变化的规律，即“时量曲线”，它包括类似“吸收、分布、代谢、排泄”ADME的4个过程，简而言之，核心要素就是有无足够的灭菌介质到达每一个靶部位。
针对灭菌来说，药效学，研究灭菌介质的浓度或者量与杀菌效果之间的规律，即“量效曲线”，它的理论基础为“受体占领学说”，即“与受体的亲和力”以及“受体的内在活性”；不同的灭菌剂针对的靶点有所区别，虽然作用非特异，但导致杀菌机制还是有所区别。比如过氧化氢作为高效氧化剂，其作用靶点相当多，可破坏细胞壁、细胞膜，也可以破坏膜内的蛋白质和核酸结构，因此，其无需渗透到菌体内即可发挥作用；而甲醛作为烷化剂，可使蛋白变性凝固，虽然细菌细胞壁表面也有蛋白，但如果不扩散到菌体内，甲醛只会造成表面蛋白凝固杀不死细菌，因此，必须在水相的作用下渗透到菌体内才能发挥作用。
综上所述，灭菌的成功，都离不开这两个过程。现在我们来从这两个过程分析一下，常规三种灭菌方法。
（一）过氧化氢低温等离子灭菌
从药动学上分析，过氧化氢低温等离子灭菌首先经过一次很深的抽负压过程，在负压和一定温度下，汽化的过氧化氢会弥散到腔体的各个部位。如果管腔器械长度很长或者有盲端或者结构很复杂，都会影响到负压抽真空的效果，也就会影响到过氧化氢的弥散，因此，它的穿透力是很局限的（所谓“穿透力”，即灭菌介质到达靶点的能力）。再说到达靶部位的量，不管腔体内待灭菌器械多少，过氧化氢的量是固定的，这点来说，灭菌效果有点局限。
从药效学分析，过氧化氢低温等离子灭菌主要靠过氧化氢浓度、时间、温度。其一般经历两个灭菌循环，每个循环消耗一支过氧化氢；它在每一轮灭菌开始的时候，其浓度是不断被消耗的，并没有得到补充，不像甲醛和压力蒸汽灭菌有补充气体进来；这也是它局限之一。
（二）压力蒸汽灭菌
从药动学上分析，压力蒸汽灭菌会经过脉动抽真空，抽掉冷空气的同时，饱和蒸汽也随之渗透到腔体的各个部位；其次，水蒸气在负压的作用下弥散到各个部位；同时，在弥散的过程中，高温蒸汽遇到相对低温的器械形成冷凝水形成局部负压，更加有利于穿透，即“冷凝抽吸现象”，这种现象在过氧化氢低温等离子灭菌是不存在的，因为在过氧化氢低温等离子灭菌时，器械事先经过预热，让蒸汽和器械没有温差。因此，在穿透力方面，压力蒸汽灭菌是相当出色。再说灭菌介质到达靶部位的量，通常只能从压力来反应是否充足，由于灭菌器直接连接供气管道，可实时维持既定压力。
从药效学分析，压力蒸汽灭菌主要靠灭菌温度、时间、蒸汽饱和度。在灭菌开始时，有供气管道来维持灭菌阶段的蒸汽供应。因此，相当可靠。
（三）低温甲醛灭菌
从药动学上分析，低温甲醛灭菌跟压力蒸汽灭菌类似，其穿透力表现为脉动抽真空+负压弥散+冷凝抽吸，但其冷凝抽吸现象明显弱于压力蒸汽灭菌，高温蒸汽导致的“冷凝抽吸现象”与低温蒸汽导致的“冷凝抽吸现象”不是一个级别。因此，其穿透力明显弱于压力蒸汽灭菌，好于低温等离子。再说灭菌介质到达靶部位的量，通常只能从压力来反应是否充足，由于灭菌器直接连接甲醛水溶液，可实时维持既定压力。值得一提的是，在灭菌维持阶段，其压力峰值是负压，这跟其他两者有明显不一样的地方。第一，考虑到生产安全，剧毒气体负压下保证不泄露；第二，该负压下的甲醛浓度已可达到灭菌。
从药效学分析，低温甲醛灭菌主要靠甲醛浓度、相对湿度、温度、时间。在灭菌开始时，有供气管道来维持灭菌阶段的蒸汽供应。因此，相当可靠。但由于甲醛其脂水分配系数导致其跨膜很慢，即使在65℃作用下加快，其灭菌时间相比其他两者依然要久。
综上所述，从药动学和药效学上去拆解不同的灭菌方法，能更加深刻理解临床在用各种灭菌方法，才能灵活贯通。
