Linux环境下的软件安装

第一步

• 搜索miniconda 清华
• 找到最新的miniconda链接，复制链接
• 服务器中biosoft目录下wget 链接

第二步

安装：enter——yes——enter

tips: ctrl + w 往回删除一个单词，光标放在最末尾
ctrl + u 删除光标以前的字符
ctrl + k 删除光标以后的字符
ctrl + a 移动光标至的字符头
ctrl + e 移动光标至的字符尾
ctrl + l 清屏

第三步

激活：source ~/.bashrc——conda

第四步

添加镜像
清华镜像:

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
conda config --set show_channel_urls yes

第五步

使用conda

• 查看安装软件conda list
• 搜索软件：eg:conda search fastqc
• 安装软件：eg:conda install fastqc -y
• 卸载软件：eg:conda remove fastqc -y

第六步

• 卸载conda:rm -rf ~/miniconda3
• 环境变量中去掉conda：vi ~/bash_profile

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