安装monocle2 加载时报错 object ‘clusterApply’ is not exported by 'namespace:BiocGenerics'

一开始使用conda 安装

安装方法:

Bioconductor Monocle :: Anaconda.org

但是会报错,说有冲突的包

于是我换了个code 

conda install -c  conda-forge  bioconductor-monocle

安装成功

但是在R里加载会出现 ERROR :object ‘clusterApply’ is not exported by 'namespace:BiocGenerics'


解决办法:

移除conda 安装的包

conda remove bioconductor-monocle

根据官网安装方法,进入R里安装

if (!require("BiocManager", quietly = TRUE))

    install.packages("BiocManager")

BiocManager::install("monocle")


新出现的bug :

ERROR: dependencies ‘fastICA’, ‘qlcMatrix’, ‘slam’, ‘biocViews’ are not available for package ‘monocle’


解决办法:

用conda 安装上面的依赖包后,再用BiocManager安装

(DONE)

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