Ⅰ类MHC分子
Ⅰ和Ⅱ类MHC分子的两种结构现在已经被仔细地分析了，所以我们现在已经有了一个这两种分子是什么样子的印象。Ⅰ类分子有一个结合的凹槽，两端都是关闭的，所以它们所提呈的小分子蛋白碎片（多肽类）必须和凹槽的界限匹配。（“小圆面包”，如果你愿意这么叫的话）事实上，当免疫学家从Ⅰ类分子的手中撬出多肽类并按顺序排列好它们，他们发现大部分多肽在长度上为8至11个氨基酸。这些多肽类两端是固定的，在长度上轻微的变异是通过使中心的多肽凸出一点来调节的。
每一个人类的MHCⅠ类分子有三种基因（叫做HLA-A，HLA-B，HLA-C），定位在6号染色体。因为我们有两个6号染色体（一个从妈妈那儿来，一个从爸爸那儿来），我们一共有6个Ⅰ类MHC基因。每一个Ⅰ类HLA分子蛋白和另一个蛋白配对，这个蛋白叫做β2-微球蛋白，一起组成了完整的MHCⅠ类分子。在人类中，有很多轻微不同形式的基因来编码这三种HLAⅠ类分子。比如，HLA-A蛋白至少有480种变异型基因，HLA-B基因有800种不同的以及有260种不同的HLA-C类基因。被这些基因编码的蛋白质大致都是一个形状，但是它们都有一个或几个不同的氨基酸。免疫学家叫有很多形式的分子“多态性”，HLAⅠ类分子当然和这个描述也很符合。相对而言，我们所有人都有同样的编码β2-微球蛋白的基因。
因为它们是多态性的，MHCⅠ类分子有不同的结合动机，因此可以在它们的末端提呈有不同种氨基酸的多肽。举个例子，一些MHCⅠ类分子和一端有狂犬病氨基酸的多肽连接，但是其他的MHC分子更喜欢这个锚位上的碱性氨基酸。既然人类有可能表达6种不同的Ⅰ类分子，我们的Ⅰ类分子共可以提呈很多类多肽。并且，尽管MHCⅠ类分子对于结合在多肽末端的特定氨基酸很挑剔，它们在挑选蛋白质碎片中心的氨基酸方面也非常杂乱。结果就是，一个特定的MHCⅠ类分子可以连接并提呈很多种多肽类，每一种都和提呈在其连接槽末端的特殊氨基酸“匹配”。
Ⅱ类MHC分子
像Ⅰ类分子一样，Ⅱ类MHC分子（由6号染色体HLA-D区域的基因编码）都非常具有多态性：在人类中有很多不同的Ⅱ类MHC分子的版本存在。但是，和I类MHC分子相比，Ⅱ类MHC分子的连接凹槽两端都是打开的，所以一个多肽可以在凹槽之外。正如你从这个特点所期盼的那样，连接Ⅱ类分子的多肽比占据I类分子封闭式凹槽的多肽要长——13至25个氨基酸。除此之外，对Ⅱ类MHC分子而言，固定多肽的重要氨基酸沿着连接槽排列，而不是在末端聚集。
I类MHC分子的抗原提呈
备注：新手翻译，仅供参照学习。
