左中郎将皇甫嵩、右中郎将朱儁各领一军入豫州颍川郡界，是年已由春入夏，四月光景，与黄巾渠帅波才相遇，朱儁与之交锋不利，兵败而退，〔1〕二中郎将便引军进长社县（今属河南长葛市）凭城固守。
波才乘势大举围城，皇甫嵩等兵力甚少，军中恐惧，于是据守不出。
时值五月，渐入盛夏，皇甫嵩登城俯瞰城下形势，望见波才军依蒿草扎营避暑，心生破敌之策，忙召军吏说道：
“兵有正奇之变，不在多寡。而今反贼依草结营，若趁夜火攻，贼兵必然大乱，我等四面合击必能取胜！”〔2〕
正巧当夜刮起大风，皇甫嵩便命军士扎束火把登城，又选精兵潜伏出围，绕至波才背后乘风纵火。城上一见火起，立时举火相应，皇甫嵩领兵擂鼓出城冲入围城阵中，慌得波才军惊愕无措，弃营乱奔。是时又一支军望火光而来，正是灵帝派来援军骑都尉曹操，皇甫嵩、朱儁便与曹操合兵一处，杀得波才大败，斩黄巾数万。〔3〕
捷报传入京师，灵帝大悦，立封皇甫嵩为都乡侯。
皇甫嵩等乘胜追击，六月，将波才军歼灭于阳翟县（今属河南禹州市），又追剿汝南、陈国黄巾，大败黄巾渠帅彭脱于汝南西华县（今属河南周口市西华县），其余或散或降。〔4〕〔5〕自此豫州颍川、汝南、陈国三郡黄巾终于平息。
皇甫嵩上报朝廷，推功于朱儁，皇帝拜朱儁为镇贼中郎将、封西乡侯，又诏令皇甫嵩平定兖州东郡，朱儁平定荆州南阳。
自北中郎将卢植驰赴冀州以来，连胜张角，斩获万余人，张角败走巨鹿广宗县（今属河北邢台市威县）据城坚守，卢植追至城下便即围住，挖掘堑壕、制作云梯，城池指日可破。谁知京中来了宦官小黄门左丰，奉旨视察军情，有人便劝卢植送上贿赂，卢植自是不肯。左丰果然回奏灵帝，只说卢植围而不打自待上天诛灭黄巾！皇帝盛怒之下命将卢植押入囚车解回京师治罪，又调河东太守董卓为东中郎将代其领兵。〔6〕
时值八月仲秋，皇甫嵩于东郡仓亭（今属山东聊城市阳谷县）生擒黄巾渠帅卜己，斩首七千余级。是月初三（9月25日），因董卓未能取胜于是诏令皇甫嵩驰赴冀州。〔7〕
孟冬十月，皇甫嵩移师广宗与张梁接战，前有朝廷两员大将未能取胜，更使黄巾振奋，即便皇甫嵩亦不能一时攻克，因而暂且收兵，避其锐气。
待至次日，仍是按兵不动，命兵士休息，静观其变，果然探知黄巾有所懈怠。皇甫嵩决计奇袭，乃趁夜布置兵马，拂晓时杀奔张梁营阵，直战至午后，打得黄巾支持不住，张梁身死，被斩三万人，余众大败而逃，官军赶至河边，黄巾慌不择路，竟有投河死者五万许。
自是皇甫嵩大胜，焚烧黄巾辎重三万余车，又俘获其家眷甚多，终于夺回广宗。只是不见了张角，却发现黄巾留下棺木一具，开棺验看正是张角尸首，大约皇甫嵩军抵广宗时，张角已然身故，于是戮其尸将首级传送京都。〔8〕
如今张角兄弟只剩张宝尚据守下曲阳县（今属河北晋州市），十一月，皇甫嵩连合巨鹿太守郭典同往攻之，此役又胜，斩杀张宝及黄巾十余万人，便于城南道旁积尸封土，筑起高冢，此即所谓“京观”。〔9〕
由张角兄弟所统近二十万叛军即为官军扑灭，灵帝拜皇甫嵩为左车骑将军、领〔10〕冀州牧、封槐里侯。皇甫嵩启奏皇帝，盛赞卢植用兵才略，称自己正是沿袭卢植之谋方能取胜，因而保得卢植免罪官复尚书。
八个月前（其年三月），荆州南阳郡黄巾渠帅张曼成领数万人杀太守褚贡，屯兵宛县（今属河南南阳市）城下与官军对峙百余日。六月，朝廷新任太守秦颉（字初起）率军击杀张曼成，〔11〕黄巾推赵弘为渠帅，渐渐聚集十余万人。
自镇贼中郎将朱儁承旨驰援南阳时，赵弘已据宛城，朱儁便与太守秦颉及荆州刺史徐璆（qiú，字孟玉）合兵一万八千人围攻赵弘，自六月至八月未能攻下。朝廷本欲召还朱儁问罪，所幸司空张温（字伯慎）上疏劝阻皇帝，这才作罢。
转至是年十一月，大约赵弘领军出击，朱儁相机而动，迅速击毙赵弘，黄巾又推韩忠为帅，据城固守。朱儁等毕竟兵力不敌，便稍稍撤围，扎下营垒，筑起土山，朱儁登高临城观望城内动静，忽得良策，便命一支军大张旗鼓攻城西南角，黄巾果然皆至西南防御，朱儁则自率精兵五千，乘其不备往攻东北角，部下佐军司马孙坚，奋勇当先，引兵登城而入。韩忠闻知外城失守惶惧不安，忙率军缩入内城，且派人前去请降。
徐璆、秦颉及朱儁部下司马张超等皆欲收降，朱儁不以为然，对众人说道：
“兵家有形同而势不同者，不可拘泥。昔日秦末纷争之际，天下未定，故而纳降赏附规劝群雄。如今海内一统，唯有黄巾造乱，纳降何以劝善？讨伐方可惩恶。如若受降，叛贼得势便起兵，失势则请降，此是纵敌为患！”〔12〕
韩忠请降遭拒只得竭力守城，朱儁等更督军急攻，反而连战不克。朱儁又命堆起土山，登高俯瞰，望了一阵便对司马张超说道：
“依我看来，反贼外围严密，内城危急，乞降不受，欲出不得，因而以死相拼。万人一心势不可当，何况十万之众？不如暂且撤围，将围城兵士集结入城，韩忠势必出城，既出则无心恋战，士气涣散，易为我所破！”〔13〕
韩忠果然中计，却被朱儁杀得大败，官军追击数十里，斩黄巾万余级，韩忠无奈再次请降，终被秦颉斩杀。黄巾余众恐惧不安，便推孙夏为帅，又返还宛县屯驻，朱儁麾军猛攻，孙夏望北而逃，朱儁直追至西鄂县（今属河南南阳市石桥镇）精山（约今南阳市卧龙区谢庄乡塔子山）击破之，又斩首万余级，其余作鸟兽散。〔14〕
至此南阳黄巾也为官军所平。中平二年（185年）春，朝中遣使者拜朱儁为右车骑将军，朱儁凯旋回京，又拜光禄大夫，改封钱塘侯。
黄巾初起来势汹汹，然冀、豫、荆三州主力于一年内皆为官军所败。究黄巾致败，官军取胜之由：其一，黄巾内部叛变，以致仓猝起事，大军未能迅速集结。其二，黄巾多各自为战，相互无援，官军得以各个击破。其三，黄巾无将略之才，未经军事训练，无作战经验。其四，官军所遣将领或出武官世家、或有平叛经验，皆晓得军事谋略，所以常能以少胜多。
既然黄巾主力终为官军镇厌下去，大汉天下便渐渐归于太平了吗？
〔1〕（中平元年、184年）夏四月（当月公历跨度4月28日~5月27日），……朱隽（儁）为黄巾波才所败。见《后汉书》卷八，孝灵帝纪。
〔2〕“兵有奇变，不在众寡。今贼依草结营，易为风火。若因夜纵烧，必大惊乱。吾出兵击之，四面俱合，田单之功可成也。”见《后汉书》卷七十一，皇甫嵩传。
〔3〕（中平元年）五月（跨度5月28日~6月25日），皇甫嵩、朱隽复与波才等战于长社，大破之。见《后汉书》卷八，孝灵帝纪。
〔4〕嵩、隽乘胜进讨汝南、陈国黄巾，追波才于阳翟，击彭脱于西华，并破之。见《后汉书》卷七十一，皇甫嵩传。
〔5〕（中平元年）六月（跨度6月26日~7月27日），……皇甫嵩、朱隽大破汝南黄巾于西华。见《后汉书》卷八，孝灵帝纪。
〔6〕卢植破黄巾，围张角于广宗。宦官诬奏植，抵罪。见《后汉书》卷八，孝灵帝纪。
〔7〕（中平元年）八月（跨度9月23日~10月22日），皇甫嵩与黄巾战于仓亭，获其帅。乙巳（初三，公历9月25日），诏皇甫嵩北讨张角。见《后汉书》卷八，孝灵帝纪。
〔8〕（中平元年）冬十月（跨度11月21日~12月20日），皇甫嵩与黄巾贼战于广宗，获张角弟梁。角先死，乃戮其尸。见《后汉书》卷八，孝灵帝纪。
〔9〕（中平元年）十一月（跨度12月21日~185年1月18日），皇甫嵩又破黄巾于下曲阳，斩张角弟宝。见《后汉书》卷八，孝灵帝纪。
〔10〕“领”，已任主职而兼他职不居其位者称领。
〔11〕（中平元年）六月，南阳太守秦颉击张曼成，斩之。见《后汉书》卷八，孝灵帝纪。
〔12〕“兵有形同而埶异者。昔秦项之际，民无定主，故赏附以劝来耳。今海内一统，唯黄巾造寇，纳降无以劝善，讨之足以惩恶。今若受之，更开逆意，贼利则进战，钝则乞降，纵敌长寇，非良计也。”见《后汉书》卷七十一，朱隽（儁）传。
〔13〕“吾知之矣。贼今外围周固，内营逼急，乞降不受，欲出不得，所以死战也。万人一心，犹不可当，况十万乎！其害甚矣。不如彻围，并兵入城。忠见围解，埶必自出，出则意散，易破之道也。”见《后汉书》卷七十一，朱隽（儁）传。
〔14〕（中平元年十一月）癸巳（二十二日，185年1月11日），朱隽拔宛城，斩黄巾别帅孙夏。见《后汉书》卷八，孝灵帝纪。
