现象描述：
项目使用springboot启动一个web项目，在启动阶段看到console中出现了异常“1.10.3-1.4.3\hdf5.jar 系统找不到指定的文件”，虽然这些异常不影响项目的正常运行，但作为一个严谨的技术人员，看到这些异常就像见到仇人一样，一定要除之而后快。
java.io.FileNotFoundException: D:\.m2\repository\org\bytedeco\javacpp-presets\hdf5-platform\1.10.3-1.4.3\hdf5.jar (系统找不到指定的文件。)
at java.util.zip.ZipFile.open(Native Method)
at java.util.zip.ZipFile.<init>(ZipFile.java:225)
at java.util.zip.ZipFile.<init>(ZipFile.java:155)
at java.util.jar.JarFile.<init>(JarFile.java:166)
at java.util.jar.JarFile.<init>(JarFile.java:130)
at org.apache.tomcat.util.compat.JreCompat.jarFileNewInstance(JreCompat.java:188)
at org.apache.tomcat.util.scan.JarFileUrlJar.<init>(JarFileUrlJar.java:65)
at org.apache.tomcat.util.scan.JarFactory.newInstance(JarFactory.java:49)
at org.apache.tomcat.util.scan.StandardJarScanner.process(StandardJarScanner.java:374)
at org.apache.tomcat.util.scan.StandardJarScanner.processURLs(StandardJarScanner.java:309)
at org.apache.tomcat.util.scan.StandardJarScanner.doScanClassPath(StandardJarScanner.java:266)
at org.apache.tomcat.util.scan.StandardJarScanner.scan(StandardJarScanner.java:229)
at org.apache.jasper.servlet.TldScanner.scanJars(TldScanner.java:262)
at org.apache.jasper.servlet.TldScanner.scan(TldScanner.java:104)
at org.apache.jasper.servlet.JasperInitializer.onStartup(JasperInitializer.java:101)
at org.apache.catalina.core.StandardContext.startInternal(StandardContext.java:5204)
at org.apache.catalina.util.LifecycleBase.start(LifecycleBase.java:150)
at org.apache.catalina.core.ContainerBase$StartChild.call(ContainerBase.java:1421)
at org.apache.catalina.core.ContainerBase$StartChild.call(ContainerBase.java:1411)
at java.util.concurrent.FutureTask.run$$$capture(FutureTask.java:266)
at java.util.concurrent.FutureTask.run(FutureTask.java)
at java.util.concurrent.ThreadPoolExecutor.runWorker(ThreadPoolExecutor.java:1149)
at java.util.concurrent.ThreadPoolExecutor$Worker.run(ThreadPoolExecutor.java:624)
at java.lang.Thread.run(Thread.java:748)
2019-03-29 18:09:08.303 WARN 16940 --- [ost-startStop-1] o.a.tomcat.util.scan.StandardJarScanner : Failed to scan [file:/D:/.m2/repository/org/bytedeco/javacpp-presets/hdf5-platform/1.10.3-1.4.3/hdf5-linux-x86.jar] from classloader hierarchy
java.io.FileNotFoundException: D:\.m2\repository\org\bytedeco\javacpp-presets\hdf5-platform\1.10.3-1.4.3\hdf5-linux-x86.jar (系统找不到指定的文件。)
......
2019-03-29 18:09:08.578 WARN 16940 --- [ost-startStop-1] o.a.tomcat.util.scan.StandardJarScanner : Failed to scan [file:/D:/.m2/repository/org/bytedeco/javacpp-presets/hdf5-platform/1.10.3-1.4.3/hdf5-linux-x86_64.jar] from classloader hierarchy
java.io.FileNotFoundException: D:\.m2\repository\org\bytedeco\javacpp-presets\hdf5-platform\1.10.3-1.4.3\hdf5-linux-x86_64.jar (系统找不到指定的文件。)
项目环境说明
- tomcat：使用springboot内置版本 8.5.29
- 使用Maven进行依赖管理
- spring boot 版本为2.0.1
- spring 框架 版本为5.0.5
- 项目引用了Deep Learn 4 Java（一个非常棒的Java的机器学习库）
<dependency>
<groupId>org.deeplearning4j</groupId>
<artifactId>deeplearning4j-core</artifactId>
<version>1.0.0-beta3</version>
</dependency>
-
有问题的jar依赖关系
image.png
跟踪分析
既然是在启动阶段报错，那就找到启动类添加断点，一步步跟踪下到底哪个阶段报的错误，然后再分析出错的原因。我跟踪调试了springboot的代码，找到jar的加载位置。主要的几个类和方法如下所示：
跟踪类org.apache.tomcat.util.scan.StandardJarScanner
-
方法doScanClassPath(...)
该方法会对所有classloader进行遍历，加载每一个classloader中jar包
image.png
上图标红处就是关键代码，其中变量classPathUrlsToProcess中存放的是所有待加载的jar信息，主要是jar包路径信息，我们可以看到这里面和我们在maven中看到的jar包是一样的。
image.png -
方法processURLs(...)
该方法会对当前classloader的所有jar，也就是对classPathUrlsToProcess进行堆栈操作，然后处理每一个jar包。关键代码如下所示。
image.png 方法process()
该方法会对每一个jar进行加载及分析处理，该方法中重点关注
processManifest(jar, isWebapp, classPathUrlsToProcess)
-
方法 processManifest
该方法会处理jar中的Manifest文件，对Manifest文件中的Class-Path进行分隔处理，对其中的内容作为新的依赖jar再插入到classPathUrlsToProcess中（processURLs方法会按照堆栈结果加载其中的jar）
image.png
原因分析
其实问题就是出Manifest文件中的classpath，通过分析代码我们知道tomcat除了加载了我们maven管理的jar包之外，还会对jar中的manifest文件进行分析，如果其中存在classpath，他会将其中的内容也添加jar包依赖中，并对这些jar包进行加载。
我们打开其中hdf5-1.10.3-1.4.3.jar的manifest文件作为例子看看错误出在哪里。
大家注意到了没有，这里的jar包没有路径也没有版本号，这就导致tomcat加载的时候按照hdf5-1.10.3-1.4.3.jar的路径进行加载。
然而我们的工程中在对应位置并不存在这些jar，这也就导致了找不到jar的异常。我们工程中实际上有这些jar，只不过路径和名字不一样。在上图左边大家可以看到maven中其实已经有了这些jar，只不过名字后面多了版本号，路径在各自的maven仓库中。
到这里我们已经将出现问题的原因弄清楚了，接下来我们考虑下怎么解决。
解决方案
方案一：
删除Manifest中的classpath或者删除Manifest文件，这样就避免了加载不存在的jar包。但是每次maven更新的时候可能会覆盖掉你的修改，导致异常再次出现。
方案二：
按照加载提示的路径，将对应jar包复制过去并改名去掉版本号，但这样会造成jar冗余，同样的jar会加载两个。
方案三：
降级tomcat版本，使用8.5.0 或以下版本。8.5.0版本中不会对manifest进行分析加载，这样也就不会出现我们的异常了。
方案四
增加一下代码设置不扫描Manifest文件。
@Bean
public TomcatServletWebServerFactory tomcatFactory() {
return new TomcatServletWebServerFactory() {
@Override
protected void postProcessContext(Context context) {
((StandardJarScanner) context.getJarScanner()).setScanManifest(false);
}
};
}
