我想有些小伙伴会面临这个问题,我从KEGG上搜索到了信息,怎么下载呢?
这里小编介绍一个小技巧,如何从KEGG上下载数据。
KEGG网址:https://www.kegg.jp/
其实我们可以利用一个网址来下载数据,在此用GNAS基因作为示例,其他的基因或通路也可采取同样的方式。
1,你需要事先查询基因/通路的KEGG ID,GNAS的ID是KO4632
https://www.kegg.jp/dbget-bin/www_bget?ko:K04632
image.png
2, KEGG API: https://www.kegg.jp/kegg/rest/keggapi.html
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你可以打开这个网址 http://rest.kegg.jp/get/K04632
如果是其他的KEGG ID, 则是 http://rest.kegg.jp/get/****
image.png
https://www.kegg.jp/kegg/rest/keggapi.html
3. 你可以在Linux环境下用wget下载,或者在window环境下右键另存为一个文件。
到此你就把所需信息下载下来啦!