生信学习笔记 —by xiaode

数据下载与整理

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linux系统简介

• 基本命名规则
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• 文件夹与文件管理命令
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• 常见参数
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• linux操作流程

1. 准备工作：登入服务器
2. 文本查看、操作、统计命令
   文件查看

常见参数

bioPackages <-c( 
  "stringi",  # 处理字符串
  "GEOquery", # 下载GEO数据
  "limma",    # 差异分析
  "ggfortify", "ggplot2", "pheatmap", "ggstatsplot", "VennDiagram", # 作图
  "clusterProfiler", "org.Hs.eg.db"                                 # 注释
)