bcftools安装 以及 plink 安装

bcftools安装

1、下载

下载地址:SAMtools/BCFtools/HTSlib - Downloads(http://www.htslib.org/download/)

wget -c https://github.com/samtools/bcftools/releases/download/1.14/bcftools-1.14.tar.bz2

tar xjvf bcftools-1.14.tar.bz2

2、编译

cd bcftools-1.14

./configure --prefix=/where/you/software/bcftools_1_14/

make

make install

3、写到环境变量

echo 'PATH=$PATH:/where/you/software/bcftools_1_14/bin/:$PATH' >> ~/.bashrc

source ~/.bashrc

4、测试运行

bcftools -h

测试结果长成这个丫子,就说明你的bcftools安装成功啦!!!

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plink安装

1、下载

wget https://s3.amazonaws.com/plink1-assets/plink_linux_x86_64_20210606.zip

2、解压

unzip plink_linux_x86_64_20210606.zip       ###解压后直接使用,不需要编译

3、配置环境变量

echo 'export PATH=/home/gongjiangmei/software/plink/:$PATH' >> ~/.bashrc

source ~/.bashrc

4、测试运行

plink  -h

测试结果长成这个丫子,就说明你的plink也安装成功啦!!!

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