注:本文系本人翻译于github上interproscan的安装要求

安装要求

InterProScan是为在Linux上运行而开发的。目前还没有针对Windows或苹果(MAC OS X)操作系统的版本计划。这是由于InterProScan运行的各种第三方二进制文件中的约束。

注意，InterProScan和独立的成员数据库分析是处理器和内存密集型的。、

最低规格要求是一台拥有2个核心和4 GB RAM的机器，这将允许一次分析少量序列。然而，资源越多，一次分析/分析序列的速度就越快。

软件要求

< 64位 Linux系统
< Perl 5(大多数Linux发行版的默认版本)
< Python 3 (InterProScan 5.30-69.0)
< Oracle's Java JDK/JRE version 8 (InterProScan 5.17-56.0 onwards)
< 环境变量设置
< 将 $JAVA_HOME指向JVM的位置 < 将$ JAVA_HOME/bin添加到$PATH环境变量

如何在系统上检查这些?

1. 我运行的是哪个版本的Linux ?

InterProScan是用64位二进制文件编写的。要确定您的系统是32位还是64位，请在命令行上输入:
uname -a

2.测试Perl是否安装

要测试是否安装了Perl 5，请在命令行上输入
perl -version

3.测试Python是否安装

要测试是否安装了python3，请在命令行上输入
python3 -version
python -version

4.测试Java环境

要测试您的环境，请在命令行上输入
java -version

InterProScan版本5.17-56.0或更高版本将只运行Java版本1.8+。第三行应该包括“Java HotSpot (TM)”

如果版本信息报告OpenJDK JVM, InterProScan 5也可以工作，尽管我们还没有在OpenJDK上进行广泛的测试。如果InterProScan 5不能在OpenJDK上运行，您可以获得并安装Oracle/Sun JVM (JRE或JDK比较合适，请参见http://www.oracle.com/technetwork/java/javase/downloads/index.html)。

interproscan的安装要求