NIPT解决的主要问题:如何在不到孕妇的子宫里去抽取胎儿的羊水细胞——直接、精准地检测出胎儿是否患有唐氏综合征(人工流产)
唐氏综合征(Down's Syndrom):
1. 新生儿患病率1/800,具有特征性面容 ,寿命一般可以到四十来岁,智力低下,生活无法自理。
2. 病因由于患者比正常人多了一条21号染色体(有3条)
3. 孕妇年龄越大,唐氏婴儿概率越大,35岁以上的孕妇,唐氏婴儿高达1/200(进行检测)
在高通量法诞生之前,唐氏综合症筛查方法:
方法一(血清法):
抽取孕妇的外周静脉血,并测血清中甲胎蛋白的含量高低
若甲胎蛋白含量高,则唐氏儿的可能性大(反之相反) 缺点:假阴性的概率很高(高达1/3)
方法二(羊水法):
穿刺取羊水细胞(绒毛膜细胞),培养后在显微镜下看染色体(21三体)
准确率100%,但是却有1%的流产风险(穿刺所产生的的影响)
母血(外周血)中有少量胎儿的DNA:
1. 高通量测序技术出现后,出现突破(少量DNA),每个样本一千万条(统计意义极大)
2. 方法:怀孕3个月的孕妇,抽取静脉外周血,血浆抽提血浆游离DNA(5%来源于胎儿),进行高通量测序——比对已知人基因组,看多少DNA比对21号染色体(占1.5%的长度)。
正常婴儿:21号染色体DNA占总血浆游离DNA 7.5/%%
唐氏婴儿:21号染色体DNA占总血浆游离DNA 11.25/%%(多了3.75%%)——确诊后一般建议羊水法——人工流产
高通量测序:
一次一千万条以上的序列,来筛查有多少是21染色体(其他染色体的片段)
仪器:illumina公司verify品牌——1914怀孕妇女的检测结果,假阳性率0.3%,假阴性率0%,准确率非常高
测序数据量和准确性的关系:
1. 能够测到多少21号染色体:泊松分布(当数据量很大的时候就是正态分布了)
2. 一千万条——3.75%%的差别就是3750条DNA的差别(显著)
判定界限:
实际的判断位点:
由于假阴性和和假阳性带来的后果不同(假阳性可以通过羊水穿刺再验证),所以测序公司会更偏向于出现假阳性,从而调整了判定界限
其他:
1. 三条染色体的胚胎一般活不到3月龄,除了:21号三体、18号三体、13号三体、性染色体单体或三体。能够存活
这种方法也可以检测18号三体(爱德华综合征)、13号三体(帕陶综合征)的筛查,(大部分也会流产、或1-2年死亡)
2.性染色体异常——1/1000:X、Y、XYY、XXY 能够正常生活,身高智商略差于正常人