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这个貌似是umap 版本的问题
后来重新更新了Python=3.8，scanpy=1.9.1 就没问题
附
py36
scanpy==1.7.2 anndata==0.7.8 umap==0.5.3 numpy==1.19.5 scipy==1.5.4 pandas==1.1.5 scikit-learn==0.24.2 statsmodels==0.12.2 python-igraph==0.7.1 leidenalg==0.7.0
py38
scanpy==1.9.1 anndata==0.8.0 umap==0.5.3 numpy==1.21.5 scipy==1.7.3 pandas==1.4.3 scikit-learn==1.1.1 statsmodels==0.13.2 python-igraph==0.9.11 leidenalg==0.7.0 pynndescent==0.5.7
ref.
