GeneDoc | 多序列比对总结

1️⃣ 比对软件对fasta 序列进行比对🍒
比对方法可以有MEGA(ClustalW,Muscle), ClustalX以及MAFFT等软件。还可以用GeneDoc软件自身进行比对。

无法从Github下载软件的筒子们,可以在我的网盘里下载GeneDoc软件:
链接:https://pan.baidu.com/s/1-O0zz46gmkrm6R-sI-m35w
提取码:nlqb

2️⃣ GeneDoc 进行初步美化 🍐
具体参考以下两篇文章,写的非常详细,因此不多赘述。

  1. ClustalX+GeneDoc绘制多重序列比对图
  2. GeneDoc绘制漂亮的多重序列比对图

3️⃣ Adobe Illustrator 进一步美化 🍁
AI 打开GeneDoc导出的pdf文件,美化过程如下:

  1. 字符等改为Arail,并且根据页面大小,可适当将字体大小进行调整,建议改为4~8pt。
  2. 选中白色背景的小方框,依次在菜单栏选择 选择→ 相同 → 填充颜色,由此选中了全部白色背景的方块,然后delete。
  3. 然后根据选择“0”号碱基,按照指定方向计数,每隔一定的碱基数,可用特定颜色高亮标识。
  4. 加上一些注释文字,一幅高级的多序列比对图就完成了🌝。

🥂🥂🥂

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