公元前98年
汉朝开始实行酒类专卖。
三月，汉武帝巡游泰山，继续求仙，仍然失败。
匈奴侵入雁门。雁门太守愞因畏缩惧敌被朝廷处死。
公元前97年
武帝大举袭击匈奴，匈奴还击。
公孙敖作战失利，因为之前武帝说让他接李陵回来，于是公孙敖把失利原因归于李陵帮助匈奴，李陵被抄家，之后听说不是李陵的原因。此时李陵受到单于器重，深加重用。
公元前96年
正月，公孙敖因其妻以“巫蛊”害人而被腰斩。
汉武帝强迫各郡、国的富豪和有权势的人迁居茂陵。
公元前95年
正月，汉武帝巡游回中。
赵国中大夫白公上奏修了白渠，渭中地区当地百姓因白渠而大大受益。
公元前94年
二月，武帝继续巡游。
这一年，皇子刘弗陵出生。
这时江充收到武帝亲信，武帝让他监督参劾百官和皇亲国戚，江充对于太子刘据也毫不避讳，武帝肯定他的忠心。江充此时威镇京师。
公元前93年
武帝继续巡游。
公元前92年
丞相公孙贺的夫人卫君孺，是卫皇后的姐姐，公孙贺的儿子公孙敬声接替父亲担任太仆，因为违法被捕下狱。刚好这时武帝下诏通缉阳陵大侠客朱安世，于是丞相公孙贺请让他负责追捕并宽宥他儿子。武帝批准。果然公孙贺抓到了朱安世。朱安世笑着说，丞相将要祸及全族了，从狱中上书揭发公孙敬声与阳石公主私通，另外告发公孙贺用巫术诅咒辱骂武帝。
公元前91年
正月公孙贺被逮捕下狱，经调查罪名属实，父子二人都死于狱中，并被灭族。
四月诸邑公主、阳石公主及卫皇后之弟卫青的儿子长平侯卫伉，都因巫蛊案而被处死。
汉武帝继续巡游。
武帝二十九岁才有了长子刘据对他很喜爱，之后武帝对皇后和太子冷落，于是特意告知卫青，让卫青转告太子和皇后让他们安心，自己不会随意变更继承人。
汉武帝每次出外巡游，经常将留下的事交付给太子，宫中事务交付给皇后。因为法令严苛，太子处理政事多宽厚，从轻发落。那些执法大臣都不高兴。皇后担心太子获罪，希望能遵照武帝的意思办，不应擅自决断。武帝听说后认为太子是对的，而皇后不对。群臣中，为人宽厚的都依附太子。而用法严苛的则都诋毁太子。
武帝身边人经常暗中构陷太子，详情见故事一。
此时，方士和各类神巫多聚集在京师长安。一些女巫来于宫中，教宫中美人躲避灾难的办法，在每间屋里都埋上木头人，进行祭祀。因相互妒忌争吵，就轮番告发对方诅咒皇上、大逆不道。武帝大怒下令处死有关人员，杀死数百人。一天武帝睡觉梦见几千个木头人手持棍棒想要袭击他，霍然惊醒，从此感到身体不舒服，精神恍惚，记忆力大减。江充便说皇上的病是因为有巫蛊作祟造成。于是武帝下令让其彻查，从京师长安、三辅地区到各郡、国，因此而死的先后共有数万人。江充派人故意说宫中有蛊气，需要除去，于是到太子和皇后宫中搜挖，扬言，太子宫中找出的木头人最多，还有写在丝帛上的文字，内容大逆不道，应当奏闻皇上。太子很害怕，太子老师石德献计，假传圣旨，杀死江充，否则很难脱罪。太子本来想见武帝，又被江充扣留不能见到，于是派人冒充皇帝使者，逮捕江充，亲自监杀，骂曰：赵虏！前乱乃国王父子不足邪！乃复乱吾父子也！又烧死江充手下的胡人巫师在上林苑中。
此时武帝和儿子二人兵戎相见，箭在弦上，不得不发，详情见故事二三。
汉武帝愤怒异常，群臣感到忧虑和恐惧，壶关三老令孤茂上书汉武帝，讲明太子是被人胁迫，没有造反的理由，被逼急了没办法，没有必要父子二人，弄到现在这幅样子，武帝看到奏章有所醒悟。
太子因为被人告发，无法逃脱，自缢而死。
匈奴侵入上谷、五原二郡，对当地的地方官和老百姓进行屠杀和劫掠。
公元前90年
正月，汉武帝继续巡游。
匈奴侵入五原、酒泉、杀死二郡都尉。武帝派李广利出塞袭击匈奴。
李广利出塞时，丞相刘屈氂为他送行，李广利劝丞相让自己妹妹的儿子昌邑王做太子，李广利女儿又是刘屈氂的儿媳妇。这时，有人告发丞相夫人诅咒皇上，查明属实。武帝下令臣下被腰斩，全家都被斩首，悬首示众；李广利的妻子儿女也被逮捕。李广利听说以后，非常忧虑，有人劝他，回去就是死，到时候我们和匈奴交上火，想向投降匈奴都不行了。李广利犹豫，之后与匈奴作战有所顾忌，大败投降。单于早就听说李广利是汉朝大将，便将女儿嫁给李广利为妻，对他的尊宠在卫律之上。汉武帝听说李广利投降匈奴，将其满门抄斩。
九月原城父县令公孙勇与其门客胡倩等谋反，被平定。
武帝此时已经知道太子无罪。当初针对太子的官员全部被抄家，武帝特修一座思子宫，又在湖县建造一座归来望思之台。
公元前89年
正月，汉武帝巡游东莱，想要访求仙山，群臣劝阻，武帝不听，但是海风强劲，船只不能控制，只能返回。
三月武帝亲自耕田并巡游泰山，同时对群臣说到，朕即位以来，所为狂悖，使天下愁苦，不可追悔。自今事有伤害百姓，糜费天下者，悉罢之。还说，天下哪有神仙，都是骗人的而已。
之后，汉武帝不再派兵出征表示他要使百姓得到休息，希望能增加财富，养育百姓。武帝又任命赵过为搜粟都尉在土地耕耘技术和农具制造方面改良。赵过将这些技巧教给老百姓，使老百姓用力少而收获多，因此百姓都感到很便利。
李广利被匈奴屠斩，用来祭祀。
公元前88年
燕王刘旦和其弟广陵王刘胥勇武有力，但二人的举动都不合法度，多有过失，所以二人都未被汉武帝立为太子。
皇子刘弗陵武帝想立他为太子，但是年稚母少，犹豫不决，没有合适的人选可以辅佐他。视察群臣发现只有霍光可以托付。于是画了一幅周公背负周成王接受诸侯朝见的图画赐给霍光。没几天武帝随便找个借口杀了刘弗陵母后，钩弋夫人，防止吕后之事。
公元前87年
正月，武帝病重，霍光哭着问，让谁作为继承人比较合适呢，武帝说，你难道不知道我给你的那副画的意思么。立我最小的儿子，由你担任周公的角色。霍光说我不如金日磾。金日磾说，我是外国人，不如霍光。武帝任命霍光为大司马、大将军，金日磾为车骑将军，太仆上官桀为左将军，由他们三人接受遗诏，辅佐幼主。又任命搜粟都尉桑弘羊为御史大夫，这些人全都在汉武帝卧室床下叩拜受职。
这几个人，各有神通，具体见故事四。
十四日，武帝驾崩。
十五日太子刘弗陵即皇帝位。因为只有八岁，霍光、金日磾、上官桀三人共同主管尚书事，负责主持朝政。霍光辅佐幼主，国家政令都由他自己发出，天下人都想一见他的风采。
冬季,匈奴侵入朔方郡，屠杀掳掠当地官员和百姓。汉朝征调军队屯驻西河郡，左将军上官桀巡视北部边防。
下面是故事四则摘自《资治通鉴·汉纪十三》
故事一
汉武帝与儿子们很少在一起，与皇后也难得见面。一次，太子进宫谒见皇后，太阳都转过去半天了，才从宫中出来。黄门苏文向汉武帝报告说：“太子调戏宫女。”于是汉武帝将太子宫中的宫女增加到二百人。后来太子知道了这件事，便对苏文怀恨。苏文与小黄门常融、王弼等经常暗中寻找太子的过失，然后再去添枝加叶地向汉武帝报告。对此，皇后恨得咬牙切齿，让太子禀明皇上杀死苏文等人。太子说：“只要我不做错事，又何必怕苏文等人！皇上圣明，不会相信邪恶谗言，用不着忧虑。”有一次，汉武帝感到身体有点不舒服，派常融去召太子，常融回来后对汉武帝言道：“太子面带喜色。”汉武帝默然无语。及至太子来到，汉武帝观其神色，见他脸上有泪痕，却强装有说有笑，汉武帝感到很奇怪，再暗中查问，才得知事情真相，于是将常融处死。皇后自己也小心防备，远避嫌疑，所以尽管已有很长时间不再得宠，却仍能使汉武帝以礼相待。
故事二
太子派侍从门客无且携带符节乘夜进入未央宫长秋门，通过长御女官倚华将一切报告皇后，然后调发皇家马的马车运载射手，打开武器库拿出武器，又调发长乐宫的卫卒。长安城中一片混乱，纷纷传言：“太子造反”。苏文得以逃出长安，来到甘泉宫，向汉武帝报告说太子很不像话。汉武帝说道：“太子肯定是害怕了，又愤恨江充等人，所以发生这样的变故。因而派使臣召太子前来。使臣不敢进入长安，回去报告说：“太子已经造反，要杀我，我逃了回来。”汉武帝大怒。丞相刘屈氂听到事变消息后，抽身就逃，连丞相的官印、绶带都丢掉了，派长史乘驿站快马奏报汉武帝。汉武帝问道：“丞相是怎么做的？”长史回答说：“丞相封锁消息，没敢发兵。”汉武帝生气地说：“事情已经这样沸沸扬扬，还有什么秘密可言！丞相没有周公的遗风，难道周公能不杀管叔和蔡叔吗！”于是给丞相颁赐印有玺印的诏书，命令他：“捕杀叛逆者，朕自会赏罚分明。应用牛车作为掩护，不要和叛逆者短兵相接，杀伤过多兵卒！紧守城门，决不能让叛军冲出长安城！”太子发表宣言，向文武百官发出号令说：“皇上因病困居甘泉宫，我怀疑可能发生了变故，奸臣们想乘机叛乱。汉武帝于是从甘泉宫返回，来到长安城西建章宫，颁布诏书征调三辅附近各县的军队，部署中二千石以下官员，归丞相兼职统辖。太子也派使者假传圣旨，将关在长安中都官狱中的囚徒赦免放出，命少傅石德及门客张光等分别统辖；又派长安囚徒如侯持符节征发长水和宣曲两地的胡人骑兵，一律全副武装前来会合。侍郎马通受汉武帝派遣来到长安，得知此事后立即追赶前去，将如侯逮捕，并告诉胡人，：“如侯带来的符节是假的，不能听他调遣！”于是将如侯处死，带领胡人骑兵开进长安；又征调船兵楫棹士，交给大鸿胪商丘成指挥。当初，汉朝的符节是纯赤色，因太子用赤色符节，所以在汉武帝所发的符节上改加黄缨以示区别。太子来到北军军营南门之外，站在车上，将护北军使者任安召出，颁与符节，命令任安发兵。但任安拜受符节后，却返回营中，闭门不出。太子带人离去，将长安四市的市民约数万人强行武装起来，到长乐宫西门外，正遇到丞相刘屈氂率领的军队，双方会战五天，死亡数万人，鲜血像水一样留入街边的水沟。民间都说“太子谋反”，所以人们不依附太子，而丞相一边的兵力却不断加强。
故事三
太子兵败。司直田仁故意打开城门把太子放出。丞相刘屈氂要杀田仁，御史大夫暴胜说，杀朝廷官员要告诉皇帝，怎么可以私自斩杀，于是田仁被释放，武帝之后之后大发雷霆，责备说司直放走谋反的人，丞相杀他，是执行国家的法律，你为什么要擅加阻止。暴胜自杀而死。武帝下诏收回皇后的印玺和绶带，皇后自杀。武帝认为宰相任安是老官吏，见出现战乱之事，想坐观成败，看谁取胜就归附谁，对朝廷怀有二心，因此将任安与田仁一同腰斩。太子的众门客，因曾经出入宫门，所以一律处死；凡是跟随太子发兵谋反的，一律按谋反罪灭族；各级官吏和兵卒凡非出于本心，而被太子挟迫的，一律放逐到敦煌郡。因太子逃亡在外，所以开始在长安各城门设置屯守军队。
故事四
霍光出入宫廷二十余年，出外则陪同汉武帝乘车，入宫则侍奉在汉武帝的左右，小心谨慎，从未有过什么过失。他为人沉静仔细，每次出入宫廷、下殿门，止步和前进都有一定的地方，郎官、仆射们在暗中观察、默记，发现他尺寸不差。金日磾在汉武帝身边几十年，从不看他不该看的东西，赐给他宫女，他也不敢亲近；汉武帝想将他女儿纳为后宫嫔妃，他也不肯；其诚笃谨慎如此，汉武帝感到特别奇异。金日磾的长子是汉武帝的玩童，很受宠爱，长大后行为不检点，在殿下与宫女调情，正好被金日磾看到。金日磾对其子的淫乱行为非常厌恶，便将他杀死。汉武帝听说后勃然大怒。金日磾叩头请罪，陈述了杀死其子的缘由。汉武帝深感悲哀，为此落下眼泪，后来对金日磾却由衷敬重。上官桀开始因膂力过人而得到汉武帝的赏识，被任命为未央厩令。有一次，汉武帝感到身体不舒服，等到痊愈后，检查御马，发现马匹大多瘦弱，于是汉武帝大发雷霆，说：“厩令认为我再也看不到这些马了吗！”便要将上官桀逮捕下狱。上官桀叩头说：“我听说皇上圣体欠安，日夜忧愁害怕，实在没心思照料马匹。”话未说完，已经流下几行眼泪。汉武帝认为上官桀爱自己，因此与他亲近，任命他为侍中，逐渐升到太仆。霍光、金日磾、上官桀三人都是汉武帝平时宠爱信任的人，所以特意将自己身后之事托付给他们。
此纪讲述了武帝晚年的巫蛊之祸，太子自杀，在武帝的晚年添了浓墨重彩的污渍，另一方面武帝走后刘弗陵继位，而三位大臣当中，只有霍光可以独当一面，为日后埋下伏笔。
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