NG-meta-profiler

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/367755v1.article-info
NG-meta-profiler，一个用于宏基因组的快速分析器，它执行序列预处理，比对至附带的数据库，过滤比对结果和分析（物种和功能）。它明显快于MOCAT2或htseq-count（因为它建立在NGLess上），其结果完全可重复。

  • 流程整理了人类肠道、海洋、老鼠、猪和狗的参考基因集，基因数量从1百多万到4千多万不等。


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  • 包括并行计算管理parallel，mocat宏基因组分析流程、specl物种组成分析、motu物种组成分析，minimap2比对工具等。


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