技术名 | 全称 | 简介 | 用途 | 重点 |
---|---|---|---|---|
DNA-seq | - | 识别比较全外显子组测序(WXS)和全基因组测序(WGS)数据中的体细胞变异 | 找到肿瘤中特异发生的SNV(single nucleotide variant),indel(insertion和deletion),SV(结构变异),CNV(copy number variant)等 | 变异 |
RNA-seq | - | - | 寻找表达显著差异的基因,分析lncRNA,circRNA等 | 表达量 |
scRNA-seq | 单细胞测序 | - | - | - |
MeRIP | RNA甲基化免疫沉淀 | - | 富集细胞样本内的甲基化RNA | - |
ChIP-seq | Chromatin Immunoprecipitation,染色质免疫共沉淀 | 特异性的富集与目的蛋白结合的DNA片度,对其测序分析,拿到DNA的数据 | 主要用于转录因子、组蛋白等的分析 | peaks和motif |
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