autoSeqMan:批量Sanger测序结果处理、拼接

昨天送样的sanger测序结果返回来了,可是看着ab1文件和seq文件我就有点头疼,一个一个来处理肯定是不适合我这个懒人的,一定要来批量处理的,于是乎找到了autoSeqMan这个软件。
相关论文:https://doi.org/10.24272/j.issn.2095-8137.2018.027
要使用这个软件,需要安装DNASTAR 7以上的版本还有这个软件本身。
打开软件:

软件首页界面

点击Rename
rename

在左边找到ab1所在文件夹,在Delimiter一格输入分隔符,如我这次的是“_",First index指的是,在分隔符分开后第几个元素是你的样品名字,我这里的A-3/B-3都是第二个,所以填2。点击下方rename后进入下一步。
点击Classification
Classification

在Delimiter一格输入分隔样品名的分隔符后,在subfolder一格会显示对应的样品名,如果没错点击Classification就会把各自的ab1文件分别放入对应样品名的文件夹中。

归类后

再次在上方选择Assembly,确认好DNASTAR路径和输出文件格式后,直接点击Assemble即可,软件会自动打开相应的模块并且完成组装。
组装

在rename_classOut文件夹中就可以找到组装好的序列文件了。

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