题目：2023_Computational prediction and experimental validation identify functionally conserved lncRNAs from zebrafish to human

这篇文章的核心内容是关于长非编码RNA（lncRNA）的功能研究，特别是它们在进化上的保守性和在不同物种中的同源性。研究团队开发了一个名为lncRNA Homology Explorer (lncHOME)的计算流程，用于识别具有保守基因组位置和RNA结合蛋白（RBP）结合位点模式的lncRNA。研究发现，数百个人类coPARSE-lncRNA可以在进化上追溯到斑马鱼。通过CRISPR–Cas12a敲除和拯救实验，研究人员发现敲除许多人类coPARSE-lncRNA会导致细胞增殖缺陷，而这些缺陷可以通过斑马鱼同源基因的预测来挽救。在斑马鱼胚胎中敲低coPARSE-lncRNA会导致严重的发育延迟，而这些人同源基因的拯救可以恢复发育。此外，研究还证实了人、鼠和斑马鱼coPARSE-lncRNA同源基因倾向于结合相似的RBP，并且它们的保守功能依赖于特定的RBP结合位点。

研究的主要发现和意义包括：

1. 通过lncHOME流程，识别了一类具有保守基因组位置和RBP结合位点模式的lncRNA（coPARSE-lncRNAs）。

2. 斑马鱼和人类的coPARSE-lncRNA同源基因在功能上具有保守性，这表明这些lncRNA在调节脊椎动物生理学中起着重要作用。

3. 敲除和拯救实验揭示了coPARSE-lncRNA在细胞增殖和早期胚胎发育中的关键作用。

4. 人类、小鼠和斑马鱼的coPARSE-lncRNA同源基因在RBP结合方面具有高度的相似性，这支持了它们在RBP结合功能上的保守性。

5. 研究提供了一个全面的方法来研究lncRNA的功能保守性，并为理解lncRNA的进化和机制提供了新的见解。

这项研究为lncRNA的功能研究提供了新的视角，并可能有助于揭示它们在疾病和发育过程中的作用。