这两天在安装两个依赖包NNLM和leidenbase，依次出现了gcc和gfortran的问题，用R3.6.3和R4.2.0问题都一样。必应上搜了搜，才知道是Mac环境变量问题。
先重装了gcc，按照https://www.cynkra.com/blog/2021-03-16-gfortran-macos/的提示修改~/.R/Makevars，但是发现我的Mac中没有这个文件“/usr/local/opt/gcc/bin/gfortran”，但有/opt/homebrew/Cellar/gcc/11.2.0_3/bin/gfortran，于是依葫芦画瓢将~/.R/Makevars内容修改如下：
FC = /opt/homebrew/Cellar/gcc/11.2.0_3/bin/gfortran
F77 = /opt/homebrew/Cellar/gcc/11.2.0_3/bin/gfortran
FLIBS = -L/opt/homebrew/Cellar/gcc/11.2.0_3/lib
可是还是一样报错。
又重新下载gfortran、安装，~/.R/Makevars内容修改为：
FC = /usr/local/gfortran/bin/gfortran
F77 = /usr/local/gfortran/bin/gfortran
FLIBS = -L/opt/homebrew/Cellar/gcc/11.2.0_3/lib
重启R，安装leidenbase包，报错变成了“gfortran: Permission denied”。终端运行：sudo chmod -R 777 /usr/local/gfortran/，修改权限，再重启R，安装leidenbase包，顺利完成。再顺手把NNLM装了，也是一路顺畅！
