给研一新生代课的时候，我尽量把病毒的分子生物学机制给学生多讲一点，但并不能引起同学们的兴趣，少数研究生保持傲慢与不屑。我不断给研一新生灌输：孱弱的分子生物学底子必然限制你思考问题的高度。我也会推荐学生去读一些分子生物学书籍。十几年的科研工作经历，使我越来越体会到，孱弱的分子生物学功底势必大大限制科研工作者思考问题的高度。
分子生物学主要侧重于复制、转录、表达、调控这四大块内容，这四大块内容皆与病毒的复制、转录、翻译息息相关。今天就聊聊病毒基因组复制吧，在这里只能聊聊，如果真要展开，内容体量巨大。
病毒的核酸或是DNA或是RNA，有单股的、有环状的、有单链的、有分节段的…. …种类太多了，每一病毒科基因组复制都不一样。而且，虽说病毒是细胞的“寄生虫”，但病毒基因组复制和细胞DNA复制还是差别较大。先举DNA病毒的例子吧。首先是细小病毒的复制，我们都知道细胞的DNA复制要有引物，进行半保留不连续复制，复制过程中产生冈崎片段…….（如果连这个都不知道，就说不过去了）。细小病毒是单链DNA病毒，两端存在Y字型回文结构，这种特殊结构决定着基因组在复制过程中不需要引物，或者严格来说基因组以其自身作为引物而进行基因组复制，很有意思，是吧？类似的情况，在双链DNA病毒（如痘病毒）也存在，病毒也是以自身基因组作为引物进行复制，这种现象叫做self-priming。大家可以查一查资料，还是很有意思的一种现象。
RNA病毒基因组复制机制就更显复杂，也有一些很有意思的现象，例如小RNA病毒科，是以蛋白作为引物进行基因组复制。这种蛋白叫VPg，它通常与pUpU结合，形成VPg-pUpU复合物，从而指导基因组（或反义基因组）复制，这种现象叫protein-priming，也很有意思，是吧?
RNA病毒有一个非常重要的概念：RNA依赖性RNA聚合酶（RdRp），其指导mRNA的转录，基因组与反义基因组的互相复制，重要性不言而喻。有一个比较有意思的现象，会发生在单股正链RNA病毒反义基因组复制过程中。以猪瘟病毒为例吧，其基因组是一条mRNA，5’有帽子结构，3’端有polyA结构。大家可以想象，核糖体会结合到基因组5’端，从5’端往3’端滑动从而翻译蛋白；此时呢，RdRp会结合到基因组3’端，，从3’端向5’端滑动从而复制反义基因组。这样就会导致，核糖体和RdRp将在基因组的某个位置发生“撞车”现象，那“撞车”后会发生什么，我也希望同行可以分享一下。这真是一个很有意思的现象！
好了，不展开说了，内容太多。总之，孱弱的分子生物学功底势必大大限制科研工作者思考问题的高度，这就是我对研一新生的忠告。2020-03-15
F. Liu
