序列组装策略：核心是比对

思路：通过对多条序列进行重叠比对完成对序列的组装

重叠、编排、得到一致序列

方法：

1 重叠图法  Myers 法

2 欧式路径法  IWP法  k 元组法

欧拉解答“哥尼斯堡七桥问题”

难题：大的重复序列 

解决策略：测得末端配对序列数据、构建由不同大小片段组成的文库

传统的、对用Sanger法测得的序列进行组装的算法：Phrap和CAP3

对短的读出序列进行组装的算法：Edena、Velvet、EULER SR、SASSY 和 ALLPATHS

最后编辑于 ：
©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
平台声明：文章内容（如有图片或视频亦包括在内）由作者上传并发布，文章内容仅代表作者本人观点，简书系信息发布平台，仅提供信息存储服务。