Day6-学习R包
安装和加载R包
镜像设置
（引自生信星球教程https://mp.weixin.qq.com/s/XvKb5FjAGM6gYsxTw3tcWw）
自定义CRAN和Bioconductor的下载镜像，这样可以加速R包的下载：
# options函数就是设置R运行过程中的一些选项设置
options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/")) #对应清华源
options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/") #对应中科大源
# 当然可以换成其他地区的镜像
还可以把这两行代码保存成R配置文件，可以实现在打开Rstudio的时候自动运行设置镜像。
安装R包
install.packages(“包”) 安装CRAN网站上的R包
BiocManager::install(“包”) 安装Biocductor上的R包
加载R包
library(包)
require(包)
例：安装和加载dplyr包：
options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/"))
options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/")
install.packages("dplyr")
library(dplyr)
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dplyr基础应用
新增列
mutate()
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按列筛选
select()
按列号筛选
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按列名筛选
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按行筛选
filter()
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按某列或某几列对整个表格进行排序
arrange()
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汇总
summarise()
对数据进行汇总操作,结合group_by使用实用性强
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管道操作
%>%
(cmd/ctrl + shift + M)
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统计某列的unique值
count()
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dplyr处理关系数据
內连，取交集
inner_join()
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左连
left_join()
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全连
full_join()
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半连接
返回能够与y表匹配的x表所有记录
semi_join()
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反连接
返回无法与y表匹配的x表的所有记录
anti_join()
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简单合并
bind_rows()需要两个表格列数相同
bind_cols()需要两个数据框有相同的行数
相当于base包里的cbind()函数和rbind()函数
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