10X空间转录组之细胞类型的空间pattern和空间生态位细胞类型的富集

作者，追风少年i

周五了，马上又要过礼拜天了，我真的要去鸡鸣寺烧个香问问了，把我对象弄到哪里去了？？？😄😄

今天分享一个小的知识，空间细胞类型pattern，如下图

图片.png
Spatial feature plots of the two spot patterns in FL sections

可以看到，作者的做法是把空间的注释分成了一个一个的图层，类似于我们ps的图层，一层一层叠加，每个spot含量做多的细胞类型作为First pattern，次多的为Second pattern，当然上面展示了前两种pattern。

这么做有什么好处呢？

  • 1、识别生态位
  • 2、生态位通讯
  • 3、分析细胞“团伙”
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