安装R包
CRAN Biocductor
install.packages(“包”)
BiocManager::install(“包”)
镜像
1.# options函数就是设置R运行过程中的一些选项设置
options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/")) #对应清华源
options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/") #对应中科大源
image.png
3.修改配置文件
引用生信星球
file.edit('~/.Rprofile')
image.png
最后保存=》重启Rstudio，这时你再运行一下：options()BioC_mirror 就发现已经配置好了，就很方便地省了手动运行的步骤
加载
library(包)
require(包)
[图片上传中...(image.png-43f1ac-1589377628055-0)]
dplyr应用
1.mutate
2.select
3.filter
4.arrange
5.summarise
6.>%>
7.count
8.内连inner_join
9.左连left_join
10.全连full_join
11.半连接：返回能够与y表匹配的x表所有记录semi_join
12.反连接：返回无法与y表匹配的x表的所记录anti_join
13.简单合并
14.bind_rows()列数相同，bind_cols()需要两个数据框有相同的行数
