cBioPortalData安装报错“不存在叫‘cBioPortalData’这个名字的程辑包”

问题:首先,报错“不存在叫‘cBioPortalData’这个名字的程辑包”

经过bing发现可能是包安装在了错误的路径/不完整。


解决办法:

1.尝试为安装函数加上version参数,依旧报错

BiocManager::install("cBioPortalData",version = "3.16")

注:这个version会随R版本变动而变动,报错按照R提示更改version的值就好。

2.观察下载过程,发现warning中有很多time out/很多包未下载完全

384kb,下载不了一点

于是推测是网络问题导致依赖包下载不全,因此没有报错,但是library时报错不存在包。

3.解决网络问题--选择镜像

chooseBioCmirror()


选择一个china的即可成功下载所有包。(该方法也适用于bioconductor包下载慢的问题!

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