零基础学习R语言Day3
逻辑
Linux环境下的软件安装.png
1.Linux的"应用商店"——Conda
2.给个人服务器下载Conda/miniconda（这里介绍miniconda）
2.1 进入清华miniconda镜像
2.2 确定服务器多少位: 在XShell内输入 uname -a
image.png
2.3 选择对应的版本，确定其网址，如https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-py39_4.9.2-Windows-x86_64.exe 或 https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
然后在XShell内输入 wget 网址 （wget: “World Wide Web” 与“get”）
image.png
3.安装和配制miniconda
3.1 安装: bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
过程中多个yes和enter, 直至出现
image.png
3.2 激活：source ~/.bashrc
3.3 添加镜像：
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --set show_channel_urls yes
4.入门miniconda
#4.1 当前服务器安装的软件列表
conda list
#4.2 安装软件 ,下面的fastqc 是可变的
conda install fastqc -y
#4.3 确认软件是否安装成功
fastqc --help
#4.4 下载软件
conda remove fastqc -y
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