在集群ssh software-install从ncbi下载基因组数据，用的wget --recursive --no-host-directories --cut-dirs=6 ftp://ftp.* -P ./下载到70%显示网络中断了，已经登出了，4月28号看还有文件夹在生成
图1.png
ps ux | morekillall
图2.png
killall 之后，到4月29号
图3.png
求助系统管理后发现这是个大乌龙，以下是解决方法
图4.png
- 原因：
- 找错了登录节点，此时登录节点应该是安装软件用的节点
ssh software-install - 证明
wget已经支持断点续传了
- 找错了登录节点，此时登录节点应该是安装软件用的节点
- 解决办法:
- 回到安装登录节点
$ ssh software-install Last login: Tue Apr 28 15:53:21 2020 from 10.54.25.20 - 查看此节点所有
wget的任务，在该节点用ps ux | more也可以查看$ ps -ef |grep wget thisisme 7906 1 0 Apr26 ? 00:38:54 wget --recursive --no-host-directories --cut-dirs=6 ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/all/GCA/010/614/865/GCA_010614865.1_ASM1061486v1 -P ./ thisisme 19417 19204 0 13:51 pts/16 00:00:00 grep wget 34582 29133 31112 1 11:43 pts/45 00:01:45 wget ftp://ftp.sra.ebi.ac.uk/vol1/fastq/ERR375/ERR375744/ERR375744_2.fastq.gz 70122 32614 1 0 Apr17 ? 01:37:53 wget -m -c ftp://dbnsfp:dbnsfp@dbnsfp.softgenetics.com/dbMTS1.0 -
kill 7906完美解决
- 回到安装登录节点
总结
建议加强下linux基础知识，注意问题产生的前后联系，多多理解节点概念
