首先如果你小团队或者个人开发，当然可以用Xcode，如果大公司跨部门审核调整各种，还是有个快速的原型。
吐槽一下：各种说用Xcode的无非就是显摆一下自己写代码牛掰而已。真让他做个8屏以上明天要的他就尿了。特别讨厌知乎现在这些抖机灵的。有劲吗。
如你要求，可交互。包括常用的Axrue，我试用过下面提到的所有软件，分别完整产出过不同的原型，还有一些市面上的你一看它介绍图还在用ios6的就知道不必了，说明很久没更新了。
下面这些是我按照不同的特点进行了归类，视你的具体情况而定吧。
我在选择软件这个过程中纠结了很久，也是用过在领悟真正的原理。但是这段时间的摸索对我以后也有很大帮助。
轻巧型
低保真；无控件；iOS；少交互；免费。
Pop
非常火的一款原型软件，第一次满足了大家人人都是产品经理的感觉。
方法：拍照--添加触控区--转场方式--选择图片
平台：全手机操作
缺点：分享不便。动画有如侧滑、展开、消失，快现的摇一摇。操作只可以单击。没有控件，所有东西都靠你的照片。
Tapcase
基本和pop一样，就是软件本身的UI更ios7一点，其他都一样，也是导入图片，加热区就好了。缺点也是一样的。
总结：轻巧型的就是适合简单软件且是早期，在手机上稍微复杂一点的就痛不欲生了。但问题是，如果简单到这么轻松了，那真的还需要用软件模拟吗？真的在纸上画更轻松吧。点击这种交互也不需要模拟了吧。
专业型
高保真度；自带控件；Mac+iOS；全交互；收费+免费
UIDesigner + UIDPlayer
腾讯出品的原型软件，中文，操作简单，符合国人习惯，容易上手。方便分享。
方法：windows电脑安装UIDesigner，使用现成控件进行可视化搭建，调试后通过网盘等方式发到iOS设备，用UIDPlayer打开即可。
平台：只支持Win+�iOS。可能也是优点，仅有的专门支持Win平台的原型软件。
缺点：吹毛求疵吧，逼格不高。
Briefs + Briefscase
这是我最近发现非常好的一款软件，好在对交互的支持上，如果调整细腻一点，几乎可以以假乱真。我是用它在UI定稿的情况下，提前当完成品测试交互体验的。当然也自带控件，用于原型设计。
还有三种模式，场景模式（Scene View ）和细节模式（Details View）分别负责交互设计和UI设计两个部分，在设计完成后可以在第三个模式（Overview）查看整个APP的架构。
方法：在场景模式中，添加Actors（按钮，文本段落，文本热点）和Actions（触发动作），可以设置界面跳转时的TRANSITION效果，声效，延时，Retina 空间等交互体验辅助特效。
然后在iOS设备上安装Briefscase，通过Dropbox同步后使用。
缺点：贵。1298元，感受一下。标注起来还是不太趁手。通过dropbox同步有点慢，又没办法加快，只能生等。可以先试用一下，觉得好再入手吧。
Blueprint + viewer
我最早用的原型软件，现在制作出的原型已经出现在App Store里拉。Sakura Day。
当时用免费的功能（2个项目，无法导入dropbox图片，无自定义控件）就做出来了。后来接手公司大项目，专门买了完整版128元。
但是注意，这是用iPad做，iPhone或者iPad看，没有电脑版的。我当时就是为了地铁上可以用，是优点也是缺点。
方法：基本都一样，就是在iPad上操作。触控不那么精确，但是操作体验很好，完整版的自定义库按钮很多很丰富。
平台：iPad + iOS
缺点：最重要的就是只能在iPad上编辑，我做了个大型的项目，打开还是稍慢点，但是稳定，操作多了有点累。分享需要对方装软件，而且生成的项目文件会很大。
总结： 专业软件还有很多，各有千秋，这两个是最快支持iOS7的，说明他们很重视产品保证更新。但是价格确实也是不菲，优缺点很明显，不符合国人习惯。腾讯那个整体是很不错了，除非你和我一样只用mac。
HTML型
中保真度；自带控件；全平台；需联网；少交互；收费+免费
Flinto
我是通过下面提到的Icon Stricker发现的这个网站，试用了一下发现，它的特点是快捷的热区和转场操作，但是完全不带控件，也就是网页版的�pop。需要你自己准备好图片，不管是UI还是UE，这里只负责交互。
最大的亮点就是支持滚动，前面提到的那些软件，都需要通过转场实现长图滚动，这个可以原生支持。
方法：传图，热区，转场。看起来操作很简单。
平台：全平台。
缺点：30天免费期，按月收费。不支持控件。需要浏览器支持。
Fluidui
最受推崇的网页版原型网站。控件从iOS到Android到WP。也是可以免费一个项目少量屏幕，然后按月收费。
方法：添加控件，热区，转场。
缺点：我用网页版的还是感觉有点迟缓，不痛快。胜在控件实在很全，这个是很多桌面软件都不支持的。如果针对安卓或者WP,实在没什么更好的选择了。
总结：分享方便，轻量级是最大优点。但是按月付费这个我觉得大公司不会承担这笔费用，小公司有没有必要花费在这方面都值得商榷。速度也确实有点问题。交互也不如专业型那么灵活。
超大型
高保真度；可拓展控件；自定义库；适配；少交互；收费。
Axure
绕不开的巨人，就像图片界的PS，文字界的Word。它最大的特点就是别人都用它（虽然大多是盗版），我之前也存了显出不同逼格的心试了前面那么多软件，最后绕了一大圈还是回到了它的怀抱。
回来的原因主要有三
大家都在用。这个没办法，沟通，传输，修改都方便，PC+mac都可以看。你自己逼格到了，人家都感受不了有什么用呢。
确实强大，熟练使用库和自定义控件后，效率大幅提升，远胜专业型。
生成的HTML页面自带左侧目录边栏。是的，这就是我弃用OmniGraffle的主要原因。
方法：不再赘述了，总之要用好自定义控件，这个会让效率成倍提升。
缺点：生成的原型在移动端很难用。是有方法的，其实也不错了，但是我还是懒得费心研究。之所以用这个就是为了给开发和写文档，很多标注和逻辑流程，没必要做出交互。所以不考虑用它做交互，你真都做成交互了，难道还要工程师挨个点开才能看到逻辑？
OmniGraffle
为了捍卫mac的逼格，我用了几天就放弃了。不可否认，OG在调整控件时的流畅稳健，草图的美观（前提是你用英文）等方面，能让你享受整个制作过程，这是很少见的。但是我一直搞不懂画布层共享层等等的关系，用起来失误频繁，而且，生成的html没有目录啊，文档可读性差。
方法：不再赘述。
缺点：除了前面所说，仅支持mac，生成的交互原型更难用到手机上。
总结： 是的，这两个软件不光是用来做移动交互原型的，他们的强大体现在非常多的领域，但是针对移动交互原型而言，都不适合。A胜在文档和大家都用，所以在个方面就屈从了吧。
辅助型
特定功能（动画；图标；投影）
Quartz Composer
就是专门用来制作交互动画原型的产品，免费，但是需要苹果开发者账号，学习曲线非常高，但是可以制作非常精美的强交互动画。
Facebook Paper的动画原型制作工具Origami及实现代码Pop
Liveview
PS play等都可以快速把电脑上的内容投影到手机上。但是唯独liveview可以支持交互。打开交互模式后，电脑端可以接受手机的点击和滑动手势。非常强大。
Icon Stricker
专门用来测试icon的网站，出自Flinto。快速在主屏查看图标。
总结
我现在对原型的流程是这样的：
- 用Axure绘制UE图，导出成手机尺寸图片
- 导入Briefs或者pop，加入交互，体验一下
- 把UI图转成黑白，在Axure里标注，写文档，生成html
- UI定稿再导入briefs，高保真体验
