安装和加载R包

1、设置镜像

打开RStudio，输入options()$repos查看默认镜像源情况

> options()$repos
                                        CRAN 
"https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/" 
attr(,"RStudio")
[1] TRUE
>
> options()$BioC_mirror
[1] "https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/"

Rstudio中设置下面两行代码，来自定义CRAN和Bioconductor的下载镜像。

# options函数就是设置R运行过程中的一些选项设置
>options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/")) #对应清华源
>options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/") #对应中科大源
# 也可以换成其他地区的镜像

-----------分界线----------
一劳永逸设置下载镜像~

>file.edit('~/.Rprofile')    #编辑配置文件

.Rprofile文件

2、安装R包

>install.packages(“包”)    #要安装的包在CRAN网站
>BiocManager::install(“包”)    #要安装的包在Biocductor
#包存在哪，自行百度

3、加载

#任一都可以
>library(包)
>require(包)

示例：

> options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/")) 
> options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/") 
# 安装包
> install.packages("dplyr")
# 载入包
> library(dplyr)
# 示例数据使用内置数据集iris的简化版
> test <- iris[c(1:2,51:52,101:102),]

dplyr基础函数

记录：
一个好习惯，做新项目时记得清空之前的变量，使用rm(list = ls())

(以上学习内容来自微信公众号——生信星球）