时间过的真快,课程已经过半了。
话不多说,先放上今天的主要学习内容:
1、安装R和Rstudio
- 首先确认电脑用户名为英文
- 接着下载R和Rstudio,具体操作参考 果子学生信 给自己一个全新的R语言环境
2、初步了解R和Rstudio工作界面
- R是一种编程语言,也是统计计算和绘图的环境,它汇集了许多函数,能够提供强大的功能。
- R语言软件界面简陋,通常不直接使用,而是用图形界面的Rstudio。
- RStudio是免费提供的开源集成开发环境(IDE)。
- RStudio提供了一个具有很多功能的环境,使R更容易使用,是在终端中使用R的绝佳选择。
Rstudio工作界面:
3、外观设置和基本操作
(1)设置字体大小
(2)用Rproject管理工作目录
所谓工作目录就是默认的读取和储存位置,也就是说,R语言只能和一个文件夹进行互动,这个文件夹非常重要,做不好就会导致你的脚本、文件、图片各种乱跑,找不到。
-
这里,我在桌面上建立了名为“Study-DY”的工作目录
(3)显示文件列表
直接打命令不跟路径会显示哪里?显示默认路径,也就是工作目录。相当于linux的ls。
(4)加减乘除
-
直接输入即可。
(5)赋值
- 赋值符号用<-,这是小于号加上减号,也可以按Alt加上减号
- x<- 1+2 意思是把1+2的运算结果赋值给x, 赋值后,x会显示在右上角的框,Environment里的Value列表里
- 直接输入x 回车,就会把x的值打印到控制台上
(6)删除变量
a<- 3
b<- 1
c<- 4
d<- 5+6 #赋值
rm(b) #删除变量b
rm(d,c) #删除变量d和c
rm(list = ls()) #清空所有变量
注意:括号不能为中文格式
(7)列出历史命令
history()
相当于鼠标单击右上角的history标签。当双击某个命令,它就会跳到控制台大于号后面,可以修改后运行。
(8)清空控制台
- 使用快捷键ctrl+l即可
4、用R作图
plot(rnorm(50))
#产生50个服从正态分布的随机数并画图
boxplot(iris$Sepal.Length~iris$Species,col = c("lightblue","lightyellow","lightpink"))
#绘制箱形图,设置颜色分别为浅蓝、浅黄和浅粉
注:iris是一个R语言自带的数据框,通常用作示例。iris$Sepal.Length表示iris数据框的Sepal.Length这一列数据。以此类推。
本学习内容参考微信公众号:生信星球