小RNA 比对

流程参考：https://cloud.tencent.com/developer/article/1054975

http://www.biotrainee.com/jmzeng/html_report/d/e/e/p/i/n/SmallRNA_result/index.html

总结，基因组组比对，其他数据库比对（去除tRNA, rRNA, snoRNA,), 留下miRNA 和miRNA 数据库比对，最后剩下的就是siRNA。 这是比对，比对完，就是后面表达分析，靶基因预测。。。

这个比对，除了和基因组比对外，其他都好麻烦。。。超过了我这个初级水平。

所以，我决定先按照简单的来。先往下走。。。。嗯，先这样。明天比对，和基因组。

miRNA :ftp://mirbase.org/pub/mirbase/CURRENT/

t RNA 数据库 ：GtRNAdb  链接：http://gtrnadb2009.ucsc.edu/download.html

rRNA 数据库：silva     链接：https://www.arb-silva.de/no_cache/download/archive/release_132/Exports/

snoRNA 数据库：http://lowelab.ucsc.edu/snoRNAdb/Annotations-eukaryotes.html 

下面的废掉

网站总结：https://www.researchgate.net/post/Which_are_the_bioinformatics_databases_of_snoRNA_and_snRNA

http://www.scri.sari.ac.uk/plant_snoRNA/      ///////https://www.hsls.pitt.edu/obrc/index.php?page=URL1100789250

https://www.hsls.pitt.edu/obrc/index.php?page=URL1100789250

数据库比对：https://www.jianshu.com/p/1cf669cbc7d8

Rfam 的使用。。。。

半天还是没研究太明白 http://blog.sina.com.cn/s/blog_670445240102uxhu.html

我决定，明天先比对再说。