学习小组Day3笔记--Drku

Linux系统下生信软件的安装

step1.1 查看自己系统的版本

image.png

step1.2 搜索与系统对应的Miniconda3版本

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step1.3 下载Miniconda3

wget -c 断点续传

![image.png](https://upload-images.jianshu.io/upload_images/16478094-64e01b6996c98580.png?imageMogr2/auto-orient/strip%7CimageView2/2/w/1240)

step2.1 bash安装Miniconda3

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step2.2 source激活Miniconda3

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step2.3 添加镜像

一行一行粘贴进去吧

# 使用清华镜像
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
conda config --set show_channel_urls yes
image.png

step2.4 查看当前软件列表

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step2.4 搜索软件

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step3.1 安装软件

-y自动安装

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step3.2 检查是否安装成功

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step4.1

扩展：当你要进行多个组学流程分析的时候，如果有软件冲突，可以参考下列办法

image.png

step4.2 创建另一个环境变量

image.png

step4.3 激活环境变量

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卸载软件

conda remove fastqc -y

好了，现在已经成功安装了软件，当软件出了故障无法解决时，建议直接删除Miniconda3

rm -r miniconda3/
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