序列信息——核酸信息为例
一般需要知道的核酸信息有
1\. 功能简要
2\. 基因组背景
3\. 基因信息，包括基因序列，转录本和编码产物
有很多核酸数据库，一级核酸数据库有三个：
Genebank,EMBL,DDBJ,三个组织数据互换
我们常用的一般是美国的Genebank，就是NCBI中的Nucleotide，也可以通过Gene检索。
在NCBI的Gene数据库中检索一个基因，结果如下：
点击我们需要种属的基因，进入详细页面，一般人类基因是最上面一个。
功能简要
在summary这一栏可以查看该基因的概要，也可以对其功能有一个简单的认识
右方有个框Table of contents是对整个页面的索引，可以快捷链接到指定区域
基因组背景：
可以大致查看其基因组位置和外显子数目，下面有个简单示意图表示了SUPT4H1在染色体的位置；如果想查看详细内容，可以点击右上角的Genome Date Viewer
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基因信息
我们常见需要了解的就是它在人类基因组图谱的位置，他的功能（或者富集功能），序列查找等。
基因序列——Genebank
基因，我们常需要它的核酸序列文件。对于基因序列，还需要对其内外显子做一个简单的注释，以及查找到上游2000bp左右的序列，以便后续分析。
1.如果只需要基因序列，直接点FASTA即可下载FASTA格式的序列文件，如果想详细了解该基因序列，点Genebank进入详细页，见下图方框1
2.在基因组图谱的tools里面也可以查看序列，或者比对引物
3.方框3就是SUPT4H1对应的核酸序列、外显子等在基因组图谱的位置
通过Genomic regions,transcripts,and products栏的Genebank链接到核酸数据库。
在该详细页可以查看查询基因的详细信息，包括来源位置，版本，功能区域等，在最下面是基因的的序列。
右上角的change region shown还可以自定义更改基因组位置，查看该基因的上游或者下游序列
转录本（mRNA）——NCBI Reference Sequences(RefSeq)
要想获得目的基因转录本（可变剪切）的信息，可以在NCBI的RefSeq中查看（可以下拉页面找到，或者通过右边的索引栏目，点击 Refseq直接链接到。），如下图所示。
1. NCBI：
这里SUPT4H1只有两个可变剪切，只有一个转录本NM_003168具有蛋白编码功能。
注：NCBI转录本信息更新较慢，可以在Ensembl里面查一下，这里Ensembl显示转录本是不止2个的，当然有些可能还没验证清楚，只是说可以纳入综合考虑。
2. Ensemble：
点NM_003168进去后的详情页和Genebank类似；更加方便的是，点击CDS后，最下面的序列会把CDS的序列标记成棕色，方便引物设计或者载体构建的时候复制序列。
