我今天给大家介绍的工具是Fire Browse(http://firebrowse.org/),这是由Broad研究所开发的用于TCGA数据挖掘可视化的网络平台,提供基因表达,突变等综合挖掘分析功能,类似于cBioportal。该网站在TCGA数据可视化中做的依旧不错,可以帮助大家更好使用TCGA这个资源丰富的数据库。这里我们使用wnt1进行说明。

输入wnt1后点击enter键,就可以获得结果,在结果页面可以调节显示的内容,以及关于wnt1基因的其他数据库链接,在结果中是关于wnt1基因各类肿瘤和正常人体中的表达情况。里面使用了肿瘤和正常人对比。比较遗憾的是这种可视化并没有提供下载按钮,该结果使用的时候同样需要截图。