2019.12.4
不知道为啥我的注册码激活不了，试了很久，都不行，哎。出现Please use the OmicsBox Launcher的错误。记录一下老师上课演示的吧。
分子标记被SNP代替（SSR没那么好了）
Blast2GO（商用）基因注释
现在很重要的是：二代、三代测序数据的分析、SNP个体的基因型。
结果Hits20（比对NR库，20条序列），会有的没比对上。GO数据库局部有的会比NR库详细。
OmicsBox Example Workflows
fasta-blast-mappping-annotation-graphs-charts（blast花费时间最长）
(1) Load-Load Sequences-Load Example Sequences(比对完成，字体颜色变成蓝色)
(2) Load-Load Blast Results-Load Blast Results(XML/Zip)-Create new project-select folder(直接导入文件夹，选择add files也行，导入文件)
(3) functional analysis-Blast2GO Mapping-Run GO Mapping
(4) functional analysis-Blast2GO Annotation-Run Annotation-Blast-Species Distribution
选择Number of GOs/Seq-Length GO Distribution by level 点击run。
GO IDS有3条 F分子功能 C细胞组分
GO注释：词条描述（BP生物过程、MF分子功能、CC细胞组分）结果点右键(GO IDS上)-Mapping graph
基因注释就是那样，没那么复杂。代谢组画不出来（在KEGG里画）
EC:酶 右击，没有KEGG词条（在DDBJ里）提交酶序列号，进行注释。Blast2GO EC:酶 右击，以前有KEGG，现在没有了。
基因组有几万个SNP，表型和分子连接点。
表型、SNP（测得的），用全基因组关联分析。
高通量测序数据，会用perl编程，把信息提取出来，用代码分析VCR,用perl提取基因型。
